More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0828 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0828  SOS function regulatory protein, LexA repressor  100 
 
 		 202 aa  414  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16801  SOS function regulatory protein, LexA repressor  99.5 
 
 		 202 aa  411  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13051  SOS function regulatory protein, LexA repressor  83.17 
 
 		 202 aa  354  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.220782 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19141  SOS function regulatory protein, LexA repressor  78.57 
 
 		 198 aa  332  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.212915 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0929  LexA repressor  74.75 
 
 		 207 aa  314  7e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1481  peptidase S24, LexA repressor  73.76 
 
 		 207 aa  310  1e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.939319  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14231  SOS function regulatory protein, LexA repressor  67.34 
 
 		 210 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.438746  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14471  SOS function regulatory protein, LexA repressor  66.16 
 
 		 205 aa  288  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.972775  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14611  SOS function regulatory protein, LexA repressor  64.65 
 
 		 205 aa  285  5e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.748093  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1356  SOS function regulatory protein, LexA repressor  63.68 
 
 		 205 aa  282  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2198  SOS-response transcriptional repressor, LexA  57.36 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.446469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1233  SOS-response transcriptional repressor, LexA  54.19 
 
 		 209 aa  238  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0384913  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0478  LexA family transcriptional repressor  56.35 
 
 		 200 aa  233  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.114058  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5333  SOS-response transcriptional repressor, LexA  55.56 
 
 		 201 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2186  SOS-response transcriptional repressor, LexA  54.82 
 
 		 200 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2248  SOS-response transcriptional repressor, LexA  54.82 
 
 		 200 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0496433  normal  0.289042 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1002  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.35 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  36.19 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  37.22 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  31.31 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  31.31 
 
 		 203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2152  peptidase S24, LexA repressor  35.65 
 
 		 252 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  30.35 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0427  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.18 
 
 		 243 aa  107  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783758  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  30.4 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.16 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.33 
 
 		 196 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  28.99 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  30.92 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  30.92 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  30.92 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  30.92 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  30.92 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  30.92 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.19 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  30.92 
 
 		 269 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  30.92 
 
 		 269 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  31.19 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  30.92 
 
 		 223 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3216  LexA repressor  30.53 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2805  transcriptional repressor, LexA family  32.85 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000318976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.33 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.34 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  30.24 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  29.95 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.63 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1184  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.66 
 
 		 199 aa  101  9e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  29.67 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  29.67 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3234  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.73 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168509 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  30.36 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0151  LexA family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.56 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 197 aa  98.6  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  33.33 
 
 		 239 aa  98.2  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2029  LexA repressor  30.21 
 
 		 234 aa  97.8  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.5 
 
 		 198 aa  97.1  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.32 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  31.55 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2297  LexA repressor  34.33 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0763769  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.77 
 
 		 212 aa  96.3  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.69 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  28.64 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.26 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  29.13 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  27.09 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.22 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  29.35 
 
 		 201 aa  95.5  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  30.9 
 
 		 232 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.5 
 
 		 200 aa  95.1  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.57 
 
 		 215 aa  94.7  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  31.19 
 
 		 202 aa  94.7  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0237  LexA repressor  30 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.85 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.73 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  30.34 
 
 		 233 aa  93.2  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  29.24 
 
 		 233 aa  92.8  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  30.58 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  34.07 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 258 aa  92.4  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.91 
 
 		 235 aa  92  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.29 
 
 		 207 aa  91.7  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  30.52 
 
 		 261 aa  91.7  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  30.26 
 
 		 228 aa  91.3  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  25 
 
 		 222 aa  91.3  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0668  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.65 
 
 		 207 aa  91.3  9e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.396258  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  30.9 
 
 		 241 aa  91.3  9e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  27.32 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2601  LexA repressor  32.35 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.8 
 
 		 252 aa  90.9  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.58 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  33.48 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0572  repressor LexA  31.58 
 
 		 244 aa  90.1  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0263209 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.06 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0514  LexA repressor  30.69 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25160  LexA repressor  29.95 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  29.18 
 
 		 232 aa  89.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>