More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0668 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0668  SOS-response transcriptional repressor, LexA  100 
 
 		 207 aa  403  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.396258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.9 
 
 		 204 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  31.73 
 
 		 203 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  31.25 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  39.8 
 
 		 233 aa  121  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.69 
 
 		 219 aa  121  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.04 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.72 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  40.85 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2143  LexA repressor  37.44 
 
 		 202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3283  LexA repressor  37.44 
 
 		 202 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1683  LexA repressor  36.92 
 
 		 202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141699  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.23 
 
 		 196 aa  118  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1808  transcriptional repressor, LexA family  40 
 
 		 236 aa  118  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3510  LexA repressor  37.44 
 
 		 202 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9651  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  33.17 
 
 		 222 aa  118  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1659  LexA repressor  37.44 
 
 		 202 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3599  LexA repressor  36.92 
 
 		 202 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0155169  normal  0.533875 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25160  LexA repressor  37.06 
 
 		 204 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.62 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2152  LexA repressor  36.54 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3872  LexA repressor  35.9 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315226  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  35.29 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.93 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.02 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  39.44 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.85 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1587  LexA repressor  37.06 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.477026 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  37.56 
 
 		 202 aa  115  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  39.44 
 
 		 230 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  39.44 
 
 		 230 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  39.11 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  39.44 
 
 		 230 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.81 
 
 		 252 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  37.5 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  37.37 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.5 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.3 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2167  LexA repressor  38.34 
 
 		 202 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.21 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  36.5 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  36.5 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  36.5 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  36.5 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  36.5 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  33.49 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  36.5 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  36.5 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  36.5 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  39.44 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  36.5 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  36.55 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  36.82 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  38.12 
 
 		 275 aa  112  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  38.1 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1506  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.86 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.03098  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  34.83 
 
 		 207 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.26 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.7 
 
 		 233 aa  111  9e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14510  LexA repressor  35.38 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0180  LexA repressor  36.08 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2152  peptidase S24, LexA repressor  36.28 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  33.17 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  36.92 
 
 		 238 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  33.17 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  35.78 
 
 		 246 aa  109  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2007  LexA repressor  34.9 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.417718  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  32.37 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23040  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.65 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.620289  normal  0.0692962 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3997  LexA repressor  34.87 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.54 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  35.68 
 
 		 236 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.69 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  38.07 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3974  LexA repressor  40.98 
 
 		 219 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.96 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3481  LexA repressor  36.18 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.02 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  32 
 
 		 203 aa  104  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  32.54 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0127  LexA repressor  35.05 
 
 		 205 aa  104  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0200  LexA repressor  34.36 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  33.93 
 
 		 241 aa  103  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.71 
 
 		 235 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  35.42 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2117  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.85 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  hitchhiker  0.000000326173 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0970  XRE family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  38.28 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  32 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3515  LexA repressor  34.36 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07330  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.04 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.140562  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2070  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.36 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.96 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  31 
 
 		 208 aa  102  6e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0427  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.58 
 
 		 243 aa  101  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783758  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1741  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.44 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  31.62 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  30.49 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  33.33 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>