More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_77411 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_77411  predicted protein  100 
 
 		 653 aa  1354    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02263  ribosome biogenesis GTPase Lsg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06510)  51.43 
 
 		 650 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.722478  normal  0.600285 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2179  predicted protein  44.47 
 
 		 378 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.805213  decreased coverage  0.000732595 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19438  predicted protein  38.49 
 
 		 529 aa  312  1e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0420618  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01470  GTP-binding protein, putative  57.84 
 
 		 743 aa  250  4e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06180  GTPase, putative  27.67 
 
 		 638 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  29.54 
 
 		 597 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  26.56 
 
 		 534 aa  124  6e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  26.71 
 
 		 717 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  28.35 
 
 		 443 aa  115  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  27.22 
 
 		 669 aa  112  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  25.64 
 
 		 560 aa  110  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  28.4 
 
 		 268 aa  105  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  26.07 
 
 		 562 aa  101  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  27.59 
 
 		 360 aa  100  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  25.76 
 
 		 384 aa  99  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  28.13 
 
 		 259 aa  99.4  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  25.76 
 
 		 388 aa  98.2  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  25.54 
 
 		 374 aa  97.1  9e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15435  predicted protein  33.33 
 
 		 611 aa  97.1  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183176  normal  0.664844 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  25.39 
 
 		 379 aa  95.1  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  28.31 
 
 		 256 aa  95.5  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0648076 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  27.47 
 
 		 261 aa  87  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  24.64 
 
 		 544 aa  85.5  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  25 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  24.34 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1645  GTP-binding protein HSR1-related protein  26.25 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0965414  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  26.98 
 
 		 285 aa  77  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  25.41 
 
 		 278 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3055  GTP-binding protein  25.24 
 
 		 258 aa  76.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  23.18 
 
 		 521 aa  75.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  25.41 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  25.41 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2120  GTPase  25.71 
 
 		 304 aa  73.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2142  ribosomal biogenesis GTPase  24.07 
 
 		 292 aa  73.6  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  24.6 
 
 		 292 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  26.3 
 
 		 277 aa  73.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02701  ribosomal biogenesis GTPase  27.68 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0776649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  25.56 
 
 		 280 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1561  ribosomal biogenesis GTPase  28.12 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0196  ribosomal biogenesis GTPase  23.92 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1931  GTP-binding protein YlqF  23.12 
 
 		 265 aa  70.1  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1682  GTP-binding protein HSR1-related  26.45 
 
 		 324 aa  69.7  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02141  ribosomal biogenesis GTPase  24.4 
 
 		 290 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.909722  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  24.36 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  26.13 
 
 		 285 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02121  ribosomal biogenesis GTPase  23.92 
 
 		 290 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269316  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  24.15 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  28.23 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02231  ribosomal biogenesis GTPase  25.36 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02121  ribosomal biogenesis GTPase  23.2 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1785  GTP-binding  25.57 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.417498 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  22.98 
 
 		 262 aa  66.6  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2146  GTP-binding protein, HSR1-related  23.85 
 
 		 305 aa  67  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  22.98 
 
 		 262 aa  66.6  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  34.15 
 
 		 271 aa  67  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  24.84 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  27.21 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  23.89 
 
 		 312 aa  65.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  24.84 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  24.84 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  24.84 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  24.65 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  24.84 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  24.84 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0838  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  22.48 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  25.96 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  24.18 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  24.52 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  23.81 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  23.96 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  24.68 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  27.72 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  24.76 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  24.19 
 
 		 296 aa  63.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0543  GTPase family protein  30.86 
 
 		 316 aa  63.5  0.00000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0396  GTP-binding protein YlqF  22.9 
 
 		 254 aa  63.5  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.243282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  25.41 
 
 		 283 aa  63.9  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  23.41 
 
 		 280 aa  63.5  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  22.96 
 
 		 313 aa  63.9  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33865  predicted protein  23.08 
 
 		 369 aa  63.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  24.68 
 
 		 298 aa  63.5  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  31.58 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2758  GTP-binding protein, HSR1-related  28.66 
 
 		 329 aa  62.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0145905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  24.44 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  24.19 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl538  GTPase  25.41 
 
 		 315 aa  62  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607031  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0483  GTP-binding protein, HSR1-related  23.61 
 
 		 258 aa  62.4  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  23.36 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  24.76 
 
 		 287 aa  62  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27991  ribosomal biogenesis GTPase  23.92 
 
 		 289 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  24.19 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  21.84 
 
 		 281 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0919  ribosomal biogenesis GTPase  23.4 
 
 		 284 aa  62  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.294572  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  27.78 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  27.78 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  27.78 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  27.95 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4647  ribosomal biogenesis GTPase  23.62 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2474  GTP-binding protein HSR1-related  25.33 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  0.279197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>