More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_55002 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009047  PICST_49655  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 2 (Long-chain acyl-CoA synthetase 2) (Fatty acid activator 2)  76.83 
 
 		 751 aa  1215    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55002  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 752 aa  1559    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58181  long-chain fatty acid CoA ligase  42.8 
 
 		 753 aa  588  1e-166  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35069  long-chain fatty acid CoA ligase  42.78 
 
 		 718 aa  575  1.0000000000000001e-162  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.193785  normal  0.930837 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89450  long-chain-fatty-acid CoA ligase  42.09 
 
 		 720 aa  533  1e-150  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.67886  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08280  AMP-binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04270)  32.22 
 
 		 708 aa  343  8e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00660  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  29.93 
 
 		 727 aa  277  5e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.665335  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26758  predicted protein  29.91 
 
 		 630 aa  266  8.999999999999999e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0405652 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17720  precursor of ligase long chain acyl-coa ligase  30.34 
 
 		 678 aa  244  5e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24496  predicted protein  25.89 
 
 		 667 aa  188  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  27.86 
 
 		 595 aa  181  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.94 
 
 		 602 aa  175  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  27.83 
 
 		 622 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  26.55 
 
 		 612 aa  173  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  26.12 
 
 		 594 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  26.16 
 
 		 610 aa  172  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  27.56 
 
 		 618 aa  171  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  28.67 
 
 		 610 aa  171  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  26.81 
 
 		 626 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  27.41 
 
 		 622 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  25.04 
 
 		 611 aa  168  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00710  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase, putative  25.45 
 
 		 706 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  26.25 
 
 		 597 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  26.25 
 
 		 597 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  26.25 
 
 		 597 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  25.77 
 
 		 592 aa  164  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  26.19 
 
 		 613 aa  165  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  25.76 
 
 		 633 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  25.38 
 
 		 617 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0631  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  27.63 
 
 		 558 aa  164  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.365879  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  27.23 
 
 		 630 aa  164  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.79 
 
 		 606 aa  164  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  23.99 
 
 		 623 aa  163  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  27.77 
 
 		 596 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  25.61 
 
 		 603 aa  162  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1920  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.81 
 
 		 563 aa  162  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.022094  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002639  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.07 
 
 		 563 aa  161  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3837  AMP-dependent synthetase and ligase  25.81 
 
 		 601 aa  161  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  24.91 
 
 		 609 aa  160  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  27.07 
 
 		 608 aa  159  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0692269  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  26.6 
 
 		 602 aa  159  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  25.38 
 
 		 649 aa  159  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  26.52 
 
 		 606 aa  158  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  26.62 
 
 		 599 aa  157  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  26.63 
 
 		 601 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  25.86 
 
 		 602 aa  157  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  26.7 
 
 		 616 aa  157  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  26.31 
 
 		 607 aa  156  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  25.98 
 
 		 606 aa  157  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  26.12 
 
 		 607 aa  156  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  26.46 
 
 		 603 aa  156  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  26.5 
 
 		 554 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00109176  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  26.35 
 
 		 600 aa  156  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03363  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.19 
 
 		 563 aa  156  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  27.05 
 
 		 661 aa  155  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.19 
 
 		 610 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  26.28 
 
 		 603 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0675  AMP-binding protein  26.48 
 
 		 547 aa  155  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  26.2 
 
 		 610 aa  154  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  25.64 
 
 		 610 aa  154  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 		 592 aa  154  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  26.15 
 
 		 598 aa  154  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0355  AMP-binding protein  25.84 
 
 		 554 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  26.37 
 
 		 605 aa  154  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  25 
 
 		 555 aa  154  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  26.41 
 
 		 606 aa  153  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  26.06 
 
 		 610 aa  153  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  26.47 
 
 		 663 aa  152  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0349  AMP-dependent synthetase and ligase  25.31 
 
 		 554 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000814911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  27.05 
 
 		 598 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  26.58 
 
 		 509 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  26.15 
 
 		 606 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  24.6 
 
 		 607 aa  152  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  25.66 
 
 		 554 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2888  AMP-dependent synthetase and ligase  25.82 
 
 		 560 aa  152  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0719534  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0359  AMP-dependent synthetase and ligase  25.66 
 
 		 554 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00409412  decreased coverage  0.000000000100216 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  25.85 
 
 		 606 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  26.44 
 
 		 602 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  26.77 
 
 		 597 aa  150  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  25 
 
 		 615 aa  150  8e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  26.61 
 
 		 597 aa  150  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1145  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  25.16 
 
 		 607 aa  150  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  27.56 
 
 		 592 aa  150  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0356  AMP-dependent synthetase and ligase  25.8 
 
 		 554 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  23.94 
 
 		 685 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  26.94 
 
 		 555 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  25.66 
 
 		 660 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  26.76 
 
 		 547 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  26.27 
 
 		 602 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  26.7 
 
 		 587 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  26.27 
 
 		 602 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28860  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.23 
 
 		 612 aa  149  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0267  AMP-dependent synthetase and ligase  26.45 
 
 		 563 aa  149  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  27.13 
 
 		 602 aa  148  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  27.44 
 
 		 590 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2308  AMP-dependent synthetase and ligase  26.96 
 
 		 657 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0111013 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  26 
 
 		 679 aa  147  6e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  25.56 
 
 		 597 aa  147  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  25.56 
 
 		 597 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  26.12 
 
 		 600 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>