More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_48268 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_48268  amidase  100 
 
 
572 aa  1179    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02662  conserved hypothetical protein  36.53 
 
 
536 aa  319  9e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0475802  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08777  Acetamidase (EC 3.5.1.4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08158]  36.54 
 
 
548 aa  302  9e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.440236 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03957  General amidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X144]  35.98 
 
 
561 aa  274  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.696881  normal  0.0809075 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02829  General amidase-C [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C1C7]  31.88 
 
 
538 aa  272  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.308927  normal  0.124376 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02879  General amidase-BPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C1C8]  34.78 
 
 
543 aa  272  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.15418 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01840  general amidase, putative  33.52 
 
 
551 aa  271  2e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02060  amidase, putative  32.24 
 
 
556 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86089  amidase activity  34.52 
 
 
556 aa  268  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00303647  normal  0.387343 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10210  acetamidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05220)  34.88 
 
 
548 aa  267  5e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88820  Acetamidase  34.7 
 
 
548 aa  264  3e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10833  amidase (Eurofung)  32.51 
 
 
543 aa  262  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47832  Acetamidase  31.7 
 
 
541 aa  260  5.0000000000000005e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04195  conserved hypothetical protein  31.56 
 
 
598 aa  240  5e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.142073  normal  0.334259 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09138  acetamidase (Eurofung)  30.65 
 
 
585 aa  193  8e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.166655  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02180  conserved hypothetical protein  29.5 
 
 
573 aa  192  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.799124  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08303  conserved hypothetical protein  29.22 
 
 
543 aa  167  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000993365 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00783  general amidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14530)  31.67 
 
 
533 aa  161  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  29.32 
 
 
469 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12740  predicted protein  32.69 
 
 
459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.60383  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0982  indoleacetamide hydrolase  26.26 
 
 
470 aa  128  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.682972  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2120  Amidase  26.3 
 
 
447 aa  124  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  27.78 
 
 
499 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  30.9 
 
 
477 aa  120  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  30.09 
 
 
477 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.38 
 
 
485 aa  117  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  30.87 
 
 
526 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1685  amidase  28.64 
 
 
466 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  30 
 
 
477 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25.21 
 
 
485 aa  109  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  29.8 
 
 
477 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  36.48 
 
 
477 aa  108  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  27.17 
 
 
480 aa  107  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  28.08 
 
 
482 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  30.53 
 
 
475 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  28.08 
 
 
473 aa  107  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4470  Amidase  34.63 
 
 
530 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141503  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  31.76 
 
 
459 aa  106  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3985  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25.94 
 
 
489 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.825512  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.41 
 
 
475 aa  104  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3666  amidase  31.44 
 
 
466 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  26.04 
 
 
549 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  27.18 
 
 
495 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.88 
 
 
483 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.26 
 
 
483 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  25.15 
 
 
469 aa  101  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0413  amidase  32.3 
 
 
466 aa  100  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1577  amidase  30.15 
 
 
478 aa  100  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5269  amidase  29.46 
 
 
467 aa  100  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357153  normal  0.248065 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  29.69 
 
 
509 aa  100  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  23.79 
 
 
458 aa  100  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2081  amidase  26.98 
 
 
524 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  28.9 
 
 
472 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2277  hypothetical protein  26.68 
 
 
469 aa  99.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2627  amidase  30.41 
 
 
466 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  33.78 
 
 
494 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  33.78 
 
 
494 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3512  amidase  30.46 
 
 
466 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  33.78 
 
 
494 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1969  amidase  27.78 
 
 
470 aa  98.2  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2304  hypothetical protein  26.45 
 
 
469 aa  97.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4006  amidase  30.15 
 
 
466 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525066  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  34.22 
 
 
494 aa  97.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  34.51 
 
 
494 aa  97.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7676  amidase  30.89 
 
 
471 aa  97.4  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616001  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  33.33 
 
 
494 aa  97.1  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  31.33 
 
 
472 aa  97.1  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1115  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  35.59 
 
 
485 aa  97.1  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00160205  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  33.91 
 
 
466 aa  97.1  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  24.25 
 
 
479 aa  96.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3768  amidase  34.84 
 
 
498 aa  96.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.30926  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1407  amidase  27.8 
 
 
473 aa  96.3  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3474  indole acetimide hydrolase  27.43 
 
 
484 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.027239 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  31.65 
 
 
490 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  34.51 
 
 
463 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3471  amidase  28.84 
 
 
465 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  24.75 
 
 
480 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.74 
 
 
475 aa  95.1  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  33.33 
 
 
494 aa  95.1  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  29.84 
 
 
475 aa  95.1  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4149  amidase  31.66 
 
 
465 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706387  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0068  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.96 
 
 
474 aa  94.7  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000049622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  31.22 
 
 
490 aa  94.7  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6072  amidase  31.41 
 
 
471 aa  94.4  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.23 
 
 
486 aa  94  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3449  amidase  29.64 
 
 
467 aa  93.6  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  27.31 
 
 
467 aa  93.2  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  27.49 
 
 
479 aa  93.2  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  23.83 
 
 
486 aa  93.2  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1257  amidase  24.7 
 
 
464 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61145  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1350  amidase  31.65 
 
 
446 aa  93.2  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149618  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1265  amidase  24.7 
 
 
464 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6296  amidase  25.22 
 
 
464 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  30.22 
 
 
474 aa  92.8  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1403  amidase  24.7 
 
 
464 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5709  indole acetimide hydrolase  31.87 
 
 
484 aa  92.8  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.07 
 
 
489 aa  92.8  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  34.23 
 
 
464 aa  92  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0798  amidase  32.59 
 
 
485 aa  92  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.286428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.91 
 
 
505 aa  92  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>