More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_37954 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_37954  predicted protein  100 
 
 		 174 aa  363  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0776157  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09469  50S ribosomal protein L13 (AFU_orthologue; AFUA_2G10510)  46.78 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03010  mitochondrial ribosomal protein L23, putative  46.56 
 
 		 163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0650415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  47.2 
 
 		 143 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  45.6 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  47.15 
 
 		 142 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  47.15 
 
 		 142 aa  112  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  47.15 
 
 		 142 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  47.15 
 
 		 142 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  47.15 
 
 		 142 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  44.72 
 
 		 142 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  46.03 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  43.2 
 
 		 142 aa  111  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  44.88 
 
 		 142 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  43.2 
 
 		 144 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  41.84 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  43.2 
 
 		 142 aa  110  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  46.34 
 
 		 142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  46.34 
 
 		 142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  46.34 
 
 		 142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  46.4 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  46.4 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  45.53 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  46.4 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  43.31 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  46.34 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  46.4 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  46.4 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2727  ribosomal protein L13  43.9 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000734549  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  46.4 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  46.34 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  42.4 
 
 		 143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  46.4 
 
 		 142 aa  108  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1547  ribosomal protein L13  42.97 
 
 		 144 aa  108  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00044315  hitchhiker  0.00000000000000212173 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2070  50S ribosomal protein L13  44.12 
 
 		 142 aa  108  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000721803  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  45.6 
 
 		 142 aa  108  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  44.8 
 
 		 142 aa  107  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  46.4 
 
 		 142 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  47.15 
 
 		 142 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  40.62 
 
 		 146 aa  107  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  43.31 
 
 		 142 aa  107  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  40.62 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  43.8 
 
 		 142 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  43.85 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  42.42 
 
 		 142 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  44 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  45.53 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  45.6 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  45.6 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0721  50S ribosomal protein L13  39.71 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0869  ribosomal protein L13  41.41 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  44.72 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  42.4 
 
 		 142 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  42.52 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  42.4 
 
 		 144 aa  103  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  46.34 
 
 		 142 aa  103  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1729  50S ribosomal protein L13  46.4 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  43.09 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  41.73 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  44.72 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  39.71 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  39.71 
 
 		 143 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0252  ribosomal protein L13  40.74 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  43.2 
 
 		 143 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  42.4 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  41.04 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  42.06 
 
 		 151 aa  101  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  42.4 
 
 		 149 aa  101  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  38.97 
 
 		 143 aa  101  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  41.04 
 
 		 143 aa  101  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  45.16 
 
 		 146 aa  101  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  42.4 
 
 		 148 aa  101  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  41.04 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0482  50S ribosomal protein L13  38.85 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150083  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  42.98 
 
 		 142 aa  100  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0505  50S ribosomal protein L13  41.41 
 
 		 143 aa  100  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  39.37 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  43.65 
 
 		 142 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  42.19 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2044  ribosomal protein L13  40.77 
 
 		 142 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000510712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  40.8 
 
 		 142 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  40.8 
 
 		 142 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  42.06 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0852  50S ribosomal protein L13  43.09 
 
 		 142 aa  99.8  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000022737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4678  50S ribosomal protein L13  38.97 
 
 		 143 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.44664  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2704  50S ribosomal protein L13  39.84 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191056  normal  0.974545 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  40.16 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_447  ribosomal protein L13  41.41 
 
 		 143 aa  99.8  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000466788  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  38.24 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  42.64 
 
 		 151 aa  99.8  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  43.2 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  39.84 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0049  ribosomal protein L13  40.62 
 
 		 142 aa  99.8  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1693  50S ribosomal protein L13  40.62 
 
 		 149 aa  99.8  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0818735  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  44.09 
 
 		 142 aa  99.8  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  41.41 
 
 		 145 aa  99  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0649  50S ribosomal protein L13  42.06 
 
 		 142 aa  99.4  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.71181e-17  normal  0.0947726 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  41.73 
 
 		 144 aa  99  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1233  50S ribosomal protein L13  39.84 
 
 		 142 aa  99  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4113  50S ribosomal protein L13  40.94 
 
 		 142 aa  99  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>