More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29306 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_29306  predicted protein  100 
 
 		 483 aa  974    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32724  predicted protein  41.65 
 
 		 569 aa  391  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375638  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00581  MATE efflux family protein (Eurofung)  44.72 
 
 		 622 aa  371  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54310  predicted protein  41.23 
 
 		 606 aa  369  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0389645 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30992  ethionine resistance protein  40.57 
 
 		 589 aa  349  5e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.628726 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06870  MATE efflux family protein (Eurofung)  34.13 
 
 		 507 aa  246  4.9999999999999997e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  28.34 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  26.21 
 
 		 460 aa  151  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  28.18 
 
 		 456 aa  150  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  25.69 
 
 		 457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03760  conserved hypothetical protein  25.97 
 
 		 763 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 460 aa  133  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  27.49 
 
 		 461 aa  133  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  25.43 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  25.43 
 
 		 477 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  26.27 
 
 		 466 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  24.37 
 
 		 457 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  29.13 
 
 		 442 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  24.37 
 
 		 457 aa  124  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  24.37 
 
 		 457 aa  124  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  25.46 
 
 		 457 aa  123  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  25.23 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  24.14 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  24.71 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  24.64 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  24.94 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  24.94 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  24.71 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0387  multidrug efflux protein  25.33 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273741  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  24.94 
 
 		 457 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  23.4 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  25.12 
 
 		 425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  24.94 
 
 		 457 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  24.71 
 
 		 457 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  24.71 
 
 		 457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  24.71 
 
 		 457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 457 aa  117  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  24.71 
 
 		 457 aa  117  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  24.71 
 
 		 457 aa  117  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  24.41 
 
 		 457 aa  117  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  24.6 
 
 		 452 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  24.49 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  24.54 
 
 		 458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  24.49 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  23.62 
 
 		 457 aa  116  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  26.33 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  26.33 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  26.33 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1702  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 453 aa  115  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  26.33 
 
 		 453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  26.33 
 
 		 454 aa  114  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_47105  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  25.11 
 
 		 482 aa  113  8.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  22.6 
 
 		 475 aa  113  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  24.84 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2247  Na+-driven multidrug efflux pump  22.3 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2538  MATE efflux family protein  23.37 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  27.78 
 
 		 464 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  24.04 
 
 		 455 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  28.21 
 
 		 470 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  27.31 
 
 		 468 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  23.72 
 
 		 472 aa  109  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  27.31 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  27.31 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  27.31 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  27.31 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  27.31 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  26.74 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  24.29 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  28 
 
 		 470 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  22.47 
 
 		 452 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  23.94 
 
 		 453 aa  107  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  26.2 
 
 		 453 aa  107  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  26.58 
 
 		 453 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  23.36 
 
 		 458 aa  106  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  28.84 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  23.48 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  25.65 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  23.98 
 
 		 454 aa  104  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48159  predicted protein  24.94 
 
 		 509 aa  103  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2909  multidrug efflux protein  28.21 
 
 		 449 aa  103  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144905  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  27.24 
 
 		 459 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  27.24 
 
 		 459 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  25.65 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  23.23 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  27.24 
 
 		 459 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 462 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 462 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  25.8 
 
 		 459 aa  100  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 458 aa  100  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 458 aa  97.8  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2122  multi anti extrusion protein MatE  25.98 
 
 		 450 aa  98.2  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000217461  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  25.55 
 
 		 465 aa  98.2  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  22.56 
 
 		 459 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  25.94 
 
 		 462 aa  97.8  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  23.44 
 
 		 450 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>