More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9372 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_9372  predicted protein  100 
 
 		 504 aa  1051    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89073  predicted protein  43.98 
 
 		 1031 aa  430  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161283  normal  0.722598 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88728  predicted protein  44.89 
 
 		 1141 aa  420  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.690875  normal  0.12515 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00950  mRNA export factor elf1, putative  43.52 
 
 		 1100 aa  420  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.484404  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06651  mRNA-nucleus export ATPase (Elf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03580)  42.72 
 
 		 1118 aa  412  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90176  translation elongation factor  43.31 
 
 		 1048 aa  405  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.902447  normal  0.536047 
 
 
-
 
NC_006686  CND02420  elongation factor 3  42.94 
 
 		 1055 aa  402  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.103235  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06700  elongation factor 3 (Eurofung)  42.29 
 
 		 917 aa  400  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.617822 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27838  predicted protein  40.71 
 
 		 1040 aa  387  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45865  predicted protein  39.74 
 
 		 923 aa  382  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.80899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36160  predicted protein  37.62 
 
 		 995 aa  364  2e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35279  predicted protein  39.22 
 
 		 528 aa  351  2e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169231  hitchhiker  0.00726349 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45085  predicted protein  26.89 
 
 		 533 aa  151  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10367  predicted protein  28.07 
 
 		 527 aa  149  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00520  regulation of translational elongation-related protein, putative  26.64 
 
 		 732 aa  147  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12095  frustulin 5  30.79 
 
 		 521 aa  140  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04315  ABC transporter, putative (Eurofung)  26.85 
 
 		 751 aa  131  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.21831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  29.06 
 
 		 672 aa  129  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_51174  predicted protein  27.14 
 
 		 623 aa  129  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68683  ATP-binding cassette (ABC) family, regulator of translational elongation  26.51 
 
 		 752 aa  128  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.525981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01943  ABC transporter ATP-binding protein  27.01 
 
 		 630 aa  125  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.32 
 
 		 637 aa  124  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  28.06 
 
 		 637 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  28.06 
 
 		 637 aa  124  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.06 
 
 		 637 aa  124  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  28.06 
 
 		 637 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.84 
 
 		 637 aa  124  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.06 
 
 		 637 aa  124  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.06 
 
 		 637 aa  124  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.06 
 
 		 637 aa  124  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00300  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  25.87 
 
 		 625 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681189  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.04 
 
 		 635 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  31.32 
 
 		 548 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  31.32 
 
 		 548 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  30.94 
 
 		 548 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.04 
 
 		 635 aa  120  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.99 
 
 		 637 aa  120  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  26.55 
 
 		 624 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.41 
 
 		 639 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  29.43 
 
 		 540 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  25.42 
 
 		 641 aa  118  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1075  predicted protein  26.89 
 
 		 518 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43066  predicted protein  27.36 
 
 		 631 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.287268 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14998  predicted protein  29.75 
 
 		 582 aa  117  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  26.32 
 
 		 627 aa  116  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  26.21 
 
 		 640 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  26.09 
 
 		 540 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  29.81 
 
 		 545 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  26.21 
 
 		 627 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  28.1 
 
 		 651 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.3 
 
 		 634 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  26.98 
 
 		 636 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1174  ABC transporter related  25 
 
 		 654 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.99 
 
 		 637 aa  115  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  27.48 
 
 		 636 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.48 
 
 		 635 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  27.32 
 
 		 638 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  29.4 
 
 		 564 aa  114  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41659  predicted protein  25.56 
 
 		 645 aa  113  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.666462  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.88 
 
 		 635 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.88 
 
 		 635 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.88 
 
 		 635 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.76 
 
 		 635 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3138  ABC transporter related  26.93 
 
 		 621 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00577211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0196  ABC transporter ATP-binding protein  28.52 
 
 		 636 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3467  ABC transporter related  24.4 
 
 		 625 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  25.84 
 
 		 539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  26.92 
 
 		 645 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  25.81 
 
 		 642 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  26.21 
 
 		 633 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1404  ABC transporter-related protein  28.78 
 
 		 640 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0880457  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0217  ABC transporter related  28.52 
 
 		 636 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631932  normal  0.82416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  25.97 
 
 		 636 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  27.84 
 
 		 637 aa  111  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  26.33 
 
 		 629 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  25.58 
 
 		 540 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  28.8 
 
 		 575 aa  111  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5997  ABC transporter ATP-binding protein  26.88 
 
 		 638 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0220  ABC transporter related  29.37 
 
 		 615 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  25.84 
 
 		 540 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  28.68 
 
 		 540 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  25.58 
 
 		 540 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0298  ABC transporter ATP-binding protein  28.64 
 
 		 643 aa  109  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  29.08 
 
 		 636 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  26.37 
 
 		 615 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  26.11 
 
 		 615 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  26.1 
 
 		 642 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  28.8 
 
 		 619 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  30.57 
 
 		 879 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  26.37 
 
 		 615 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  26.15 
 
 		 648 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  24.81 
 
 		 540 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  25.32 
 
 		 540 aa  108  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  26.03 
 
 		 540 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  24.04 
 
 		 636 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.83 
 
 		 640 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  24.95 
 
 		 636 aa  107  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.83 
 
 		 640 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.83 
 
 		 640 aa  107  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1754  ABC transporter related  25.88 
 
 		 625 aa  107  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>