53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_768 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_768  predicted protein  100 
 
 		 643 aa  1280    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530084  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20424  urea transporter  90.88 
 
 		 704 aa  1166    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119678  predicted protein  56.4 
 
 		 709 aa  689    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00418  urea transporter (Dur3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04870)  40.33 
 
 		 693 aa  440  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_006686  CND00530  urea transporter, putative  38.26 
 
 		 674 aa  421  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07373  solute symporter family transporter (AFU_orthologue; AFUA_6G03200)  38.58 
 
 		 699 aa  414  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52351  urea active transport protein  37.57 
 
 		 724 aa  377  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0516586  normal  0.828998 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02598  urea active transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17570)  34.53 
 
 		 680 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.811341 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55023  urea permease  31.21 
 
 		 659 aa  320  5e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32520  Urea active transport protein  33.33 
 
 		 658 aa  302  1e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29213  urea transport protein  31.46 
 
 		 668 aa  292  1e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0581449 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57505  urea transport protein  29.54 
 
 		 668 aa  286  8e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20443  normal  0.667471 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49064  urea transport protein  30.42 
 
 		 679 aa  266  5.999999999999999e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.427526  normal  0.0261396 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07557  conserved hypothetical protein  31.41 
 
 		 692 aa  246  8e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314115  hitchhiker  0.00246133 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  26.62 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  25.81 
 
 		 482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0029  Na+/solute symporter  28.06 
 
 		 488 aa  103  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.080483 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  22.44 
 
 		 476 aa  99.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  23.52 
 
 		 474 aa  99  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0248  Na+/solute symporter  23.53 
 
 		 500 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01880  Na+/proline symporter  25.11 
 
 		 587 aa  86.3  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30460  Na+/proline symporter  25.06 
 
 		 554 aa  75.1  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0720305  normal  0.147602 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1604  Na+/solute symporter  25.6 
 
 		 556 aa  66.2  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0772243 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  23.3 
 
 		 474 aa  53.9  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  25.07 
 
 		 483 aa  53.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  26.09 
 
 		 638 aa  53.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  31.54 
 
 		 527 aa  52.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  23.01 
 
 		 544 aa  52.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  28.57 
 
 		 459 aa  51.2  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  22.7 
 
 		 490 aa  50.8  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  25.27 
 
 		 461 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  27.59 
 
 		 479 aa  49.7  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  25.87 
 
 		 510 aa  48.9  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  26.61 
 
 		 500 aa  47.8  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  29.13 
 
 		 461 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.71 
 
 		 523 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  25.12 
 
 		 486 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05410  Sodium:solute symporter  24.86 
 
 		 542 aa  46.2  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184365  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  22.79 
 
 		 498 aa  46.2  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  24.2 
 
 		 571 aa  45.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  22.13 
 
 		 472 aa  45.8  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  23.31 
 
 		 483 aa  45.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  22.19 
 
 		 476 aa  45.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  24.2 
 
 		 571 aa  45.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  24.2 
 
 		 571 aa  44.3  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  24.2 
 
 		 571 aa  44.3  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  24.2 
 
 		 571 aa  44.3  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  24.2 
 
 		 571 aa  44.3  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  32.5 
 
 		 548 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4147  sodium/proline symporter  28.68 
 
 		 497 aa  44.3  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1118  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.82 
 
 		 552 aa  43.9  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191913  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0686  Na+/solute symporter  24.26 
 
 		 507 aa  43.9  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.663287  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  25.38 
 
 		 482 aa  43.9  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>