More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_55176 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_55176  predicted protein  100 
 
 
235 aa  472  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.21249  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32219  predicted protein  46.63 
 
 
156 aa  145  5e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0417317  normal  0.112837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2678  pentapeptide repeat-containing protein  38.76 
 
 
168 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0229  pentapeptide repeat protein  35.25 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.584528 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0712  hpothetical protein  37.98 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15481  hypothetical protein  37.98 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2759  pentapeptide repeat-containing protein  36.07 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1536  hypothetical protein  30 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.916018  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11321  hypothetical protein  36.72 
 
 
172 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_8317  predicted protein  42.42 
 
 
114 aa  70.5  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0135698  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1361  hypothetical protein  34.4 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11531  hypothetical protein  36.72 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0502913  normal  0.0854137 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11461  hypothetical protein  35.94 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11471  hypothetical protein  35.94 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1053  hypothetical protein  35.94 
 
 
172 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0362  pentapeptide repeat-containing protein  34.43 
 
 
163 aa  67  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.571178  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11313  predicted protein  36.36 
 
 
131 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.129582  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1115  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 
168 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2129  pentapeptide repeat-containing protein  33.08 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.283688  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0856  hypothetical protein  34.82 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4307  pentapeptide repeat-containing protein  31.78 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.154552  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19861  hypothetical protein  33.93 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.028924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4862  pentapeptide repeat-containing protein  31.78 
 
 
164 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1219  hypothetical protein  33.87 
 
 
169 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  37.21 
 
 
309 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2525  pentapeptide repeat protein  34.26 
 
 
172 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2954  pentapeptide repeat protein  31.78 
 
 
170 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.916978 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3581  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
172 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1840  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  62  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0702496 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  33.33 
 
 
219 aa  61.6  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  32.79 
 
 
174 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  33.12 
 
 
449 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3657  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
194 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08061  hypothetical protein  30.47 
 
 
170 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0575  pentapeptide repeat protein  30.3 
 
 
168 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  35.85 
 
 
277 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0592  pentapeptide repeat protein  30.3 
 
 
168 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  31.13 
 
 
311 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0183  pentapeptide repeat-containing protein  33.09 
 
 
170 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  38.68 
 
 
299 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08151  hypothetical protein  33.09 
 
 
170 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08391  hypothetical protein  34.17 
 
 
170 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16951  hypothetical protein  35.09 
 
 
198 aa  58.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.62237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3470  pentapeptide repeat-containing protein  35.51 
 
 
167 aa  58.5  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  34.19 
 
 
365 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  32.65 
 
 
973 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  34.13 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0785  hypothetical protein  30.47 
 
 
170 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.859693  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08371  hypothetical protein  34.17 
 
 
170 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1263  hypothetical protein  33.08 
 
 
169 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.06 
 
 
14916 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_10544  predicted protein  36.84 
 
 
123 aa  57  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00165486  hitchhiker  0.0000000637684 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_8430  predicted protein  42.5 
 
 
81 aa  56.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00390007  normal  0.0993453 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03791  pentapeptide repeat-containing protein  32.77 
 
 
202 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.48693 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07051  pentapeptide repeat-containing protein  28.36 
 
 
157 aa  55.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.186987  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17771  pentapeptide repeat-containing protein  38.71 
 
 
182 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.114465  normal  0.674203 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09851  hypothetical protein  28.12 
 
 
169 aa  55.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.176778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0734  pentapeptide repeat-containing protein  32.54 
 
 
144 aa  55.5  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.649319 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0921  pentapeptide repeat-containing protein  38.71 
 
 
182 aa  55.1  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  27.59 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0649  pentapeptide repeat-containing protein  27.61 
 
 
157 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11235  predicted protein  32.41 
 
 
109 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  31.86 
 
 
576 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0313  hypothetical protein  30.66 
 
 
170 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.967815  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07151  pentapeptide repeat-containing protein  27.61 
 
 
157 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.102033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  29.13 
 
 
734 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2584  pentapeptide repeat protein  28 
 
 
171 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.14087  normal  0.252585 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14041  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 
184 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.276957  normal  0.0592863 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06761  pentapeptide repeat-containing protein  27.61 
 
 
157 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.168299  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  38.38 
 
 
485 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  35.16 
 
 
293 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  31.4 
 
 
229 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  26.4 
 
 
211 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  30.71 
 
 
450 aa  53.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15111  pentapeptide repeat-containing protein  32.03 
 
 
192 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.783575  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  38.38 
 
 
453 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15511  pentapeptide repeat-containing protein  32.03 
 
 
186 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.121299  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  36.73 
 
 
360 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  31.58 
 
 
447 aa  52.8  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  36.73 
 
 
360 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  36.73 
 
 
360 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  36.73 
 
 
360 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  36.73 
 
 
360 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  36.73 
 
 
360 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  38.1 
 
 
872 aa  52.4  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  31.48 
 
 
862 aa  52.4  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15361  pentapeptide repeat-containing protein  31.25 
 
 
186 aa  52  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1609  pentapeptide repeat protein  30.4 
 
 
174 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1448  pentapeptide repeat-containing protein  32.81 
 
 
186 aa  51.6  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  24.46 
 
 
381 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  32.76 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  27.78 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  41.18 
 
 
452 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  32.29 
 
 
497 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  27.34 
 
 
961 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  30.71 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  34.18 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  31.91 
 
 
824 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1751  pentapeptide repeat-containing protein  29.9 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861009  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  30.36 
 
 
420 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>