More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46579 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46579  predicted protein  100 
 
 		 308 aa  635    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.92 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.247011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278227  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0765  hypothetical protein  33.22 
 
 		 253 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0747  hypothetical protein  32.86 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2989  short-chain alcohol dehydrogenase/reductase  31.65 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3655  short chain dehydrogenase  27.2 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0080  short chain dehydrogenase  30.25 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104238  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3341  short chain dehydrogenase  26.64 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3306  short chain dehydrogenase  26.64 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3256  short chain dehydrogenase  28.19 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3555  short chain dehydrogenase  26.64 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000931047 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3602  short chain dehydrogenase  26.64 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0750697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1662  short chain dehydrogenase  27.2 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.637972  hitchhiker  0.000000702398 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3561  short chain dehydrogenase  27.34 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3230  short chain dehydrogenase  28.96 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.272744 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5440  short chain dehydrogenase  30.86 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6980  short chain dehydrogenase  30 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4890  short chain dehydrogenase  30.38 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3250  short chain dehydrogenase  26.64 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0558976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3565  short chain dehydrogenase  27.69 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.578221  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1234  short chain dehydrogenase  28.39 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.446635  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1931  short chain dehydrogenase  28.39 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1673  short chain dehydrogenase  28.39 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0309  short chain dehydrogenase  28.39 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0946  short chain dehydrogenase  28.39 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2209  short chain dehydrogenase  28.39 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0219  short chain dehydrogenase  30.22 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4617  short chain dehydrogenase  31.17 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.891469  hitchhiker  0.00163121 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4245  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5248  short chain dehydrogenase  31.17 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5611  short chain dehydrogenase  31.17 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637794  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2223  short chain dehydrogenase  25.78 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.637126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0422  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.12 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.14 
 
 		 250 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0225  short chain dehydrogenase  32.39 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3005  short chain dehydrogenase  27.88 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1071  short chain dehydrogenase  31.95 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.41 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1035  short chain dehydrogenase  32.86 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.81 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.95 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.85 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11649  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01740  cytoplasm protein, putative  29.61 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672483  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000130997  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.14 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61312  predicted protein  30.99 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243713  normal  0.492851 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  28.12 
 
 		 705 aa  63.5  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.05 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0093  glucose/ribitol dehydrogenase  25.1 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0914  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.331162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.56 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.01 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3595  tropinone reductase  31.75 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.855153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.15 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  27.61 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.23 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  0.457646 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.05 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167231  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.09 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036497  normal  0.609933 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00618  conserved hypothetical protein  29.06 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.767704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.43 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.434402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 		 255 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.11 
 
 		 239 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.36 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2935  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.83 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1734  short chain dehydrogenase  28.5 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747593  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0881608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  27.8 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2376  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151774  normal  0.0467336 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.54 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.46 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.03 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.47 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1160  short chain dehydrogenase  26.13 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0211991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  27.54 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3549  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  25.59 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.44 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.157395 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0375  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.187579 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  27.41 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3544  short chain dehydrogenase  30.93 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16365  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.41 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  26.12 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.94 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0420142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.38 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0298  sorbitol dehydrogenase  29.55 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1892  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.47 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.362841  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.65 
 
 		 535 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61705 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22780  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  27.41 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.503497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.58 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.707751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>