71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45690 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  100 
 
 		 1015 aa  2100    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  31.45 
 
 		 892 aa  242  2.9999999999999997e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  39.76 
 
 		 235 aa  169  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06694  Chromosome transmission fidelity protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C1D3]  25.85 
 
 		 993 aa  121  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0563098 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  25.43 
 
 		 1001 aa  99.8  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  28.03 
 
 		 422 aa  95.1  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  25.62 
 
 		 764 aa  92.8  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  25.78 
 
 		 498 aa  92.4  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48947  predicted protein  24.03 
 
 		 725 aa  90.5  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00599657 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  28.57 
 
 		 1092 aa  89  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  25.61 
 
 		 421 aa  87.8  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  23.47 
 
 		 423 aa  87.4  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  24.18 
 
 		 942 aa  87  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  25.26 
 
 		 422 aa  84  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  28.43 
 
 		 418 aa  77  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  29.33 
 
 		 642 aa  75.1  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  29.95 
 
 		 497 aa  74.3  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  27.14 
 
 		 413 aa  73.9  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  26.27 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  27.14 
 
 		 405 aa  72  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  25.81 
 
 		 482 aa  71.6  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  26.28 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  25.81 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  27.2 
 
 		 481 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  26 
 
 		 492 aa  70.1  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  24.62 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  31.22 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  26.15 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  26.35 
 
 		 451 aa  66.6  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  25.13 
 
 		 443 aa  66.6  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  25.76 
 
 		 500 aa  65.5  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15652  predicted protein  25 
 
 		 894 aa  65.1  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  29.06 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43936  predicted protein  27.31 
 
 		 1223 aa  61.6  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  26.15 
 
 		 507 aa  60.1  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  22.42 
 
 		 476 aa  60.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  24.28 
 
 		 319 aa  60.1  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  25.56 
 
 		 437 aa  59.7  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  23.01 
 
 		 329 aa  59.7  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  24.88 
 
 		 497 aa  59.7  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  26.21 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  25.48 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  25 
 
 		 320 aa  57.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  25.88 
 
 		 497 aa  57.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  23.43 
 
 		 329 aa  56.6  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  23.79 
 
 		 326 aa  54.3  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  23.75 
 
 		 328 aa  53.9  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  23.14 
 
 		 322 aa  53.5  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  25.23 
 
 		 467 aa  53.1  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  26.05 
 
 		 348 aa  52.8  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  25.69 
 
 		 369 aa  52  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  26.05 
 
 		 318 aa  51.2  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  26.34 
 
 		 363 aa  50.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  27.4 
 
 		 733 aa  48.9  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  25.59 
 
 		 315 aa  48.9  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  24.26 
 
 		 326 aa  47.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  25.59 
 
 		 315 aa  47  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0899  ATPase  24.42 
 
 		 360 aa  47  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  24.15 
 
 		 325 aa  46.6  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  25.59 
 
 		 315 aa  47  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31554  replication factor ATPase  37.35 
 
 		 786 aa  47  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000494738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8086  predicted protein  24.58 
 
 		 114 aa  46.2  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2422  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.75 
 
 		 352 aa  45.8  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  31.33 
 
 		 298 aa  45.8  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  30.1 
 
 		 289 aa  45.8  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1945  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.96 
 
 		 360 aa  45.4  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.42736  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  25.11 
 
 		 721 aa  45.4  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  24.75 
 
 		 387 aa  45.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  34.67 
 
 		 354 aa  45.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  34.67 
 
 		 355 aa  45.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.5 
 
 		 363 aa  44.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>