197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0923 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0923  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 111 aa  220  6e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.816784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4876  ribosome-binding factor A  48.18 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.26776 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1069  ribosome-binding factor A  47.75 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0998  ribosome-binding factor A  45.95 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00108919  normal  0.25507 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3629  ribosome-binding factor A  43.75 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0781  ribosome-binding factor A  40.35 
 
 		 130 aa  97.1  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4166  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000106795  hitchhiker  0.00000000804111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0393  ribosome-binding factor A  38.74 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03290  ribosome-binding factor A  38.53 
 
 		 132 aa  83.6  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441975  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0368  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159363  normal  0.435945 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0403  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000114311  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1461  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00371256  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  36.11 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  36.11 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  36.11 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  34.82 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  36.11 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  36.11 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  36.28 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  36.28 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  35.19 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  34.55 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  34.82 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  35.19 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  35.19 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  36.61 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  34.55 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  35.19 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1778  ribosome-binding factor A  35.45 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00495715  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  35.19 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  34.26 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  34.82 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0243  hypothetical protein  29 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0399  ribosome-binding factor A  35.78 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000842232  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0370  ribosome-binding factor A  34.55 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000258707  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  32.14 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1310  ribosome-binding factor A  32.71 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.03706  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  33.93 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2294  ribosome-binding factor A  28.83 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.121706 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  32.46 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  31.25 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0301  ribosome-binding factor A  32.73 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  33.63 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  29.63 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  32.41 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1046  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0370  ribosome-binding factor A  30.63 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  32.17 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3931  ribosome-binding factor A  34.09 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  30.43 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3046  ribosome-binding factor A  30.95 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4066  ribosome-binding factor A  34.15 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  27.68 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  34.78 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  34.78 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  29.57 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  29.2 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0180  ribosome-binding factor A  37.66 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.708366  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0204  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01304  ribosome-binding factor A  37.35 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.435847  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4619  ribosome-binding factor A  28.18 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  31.48 
 
 		 127 aa  52.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3782  ribosome-binding factor A  29.46 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0911878  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0086  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  32.14 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2815  ribosome-binding factor A  33.91 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473664  hitchhiker  0.00211169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2610  ribosome-binding factor A  27.27 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2814  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0327  ribosome-binding factor A  28.04 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  30.63 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  30.63 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0955  ribosome-binding factor A  30.7 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.676636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  27.52 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  32.38 
 
 		 119 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0434  ribosome-binding factor A  28.95 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  27.52 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  30.28 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  29.09 
 
 		 120 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl371  ribosome-binding factor A  34.29 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.61579e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0175  ribosome-binding factor A  31.96 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.146816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  30.56 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0226  ribosome-binding factor A  29.46 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01261  ribosome-binding factor A  30.69 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0310075  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0991  ribosome-binding factor A  31.19 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00061052  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  25.69 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0382  ribosome-binding factor A  32.46 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0025  ribosome-binding factor A  30.49 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0481  ribosome-binding factor A  32.93 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214856  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0746  ribosome-binding factor A  30.38 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321784  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  31.63 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  31.63 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>