More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1230 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 117 aa  237  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  44.44 
 
 		 116 aa  113  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  43.59 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 		 118 aa  110  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  43.59 
 
 		 116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  42.61 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  45.05 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  45.05 
 
 		 118 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  44.14 
 
 		 118 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  44.14 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  46.02 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  44.14 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  44.14 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  44.63 
 
 		 132 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  44.63 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  44.63 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  43.1 
 
 		 119 aa  104  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  44.63 
 
 		 132 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 119 aa  103  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  45.61 
 
 		 118 aa  104  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 118 aa  103  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 119 aa  103  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  43.64 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  42.73 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  45.45 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  43.86 
 
 		 119 aa  100  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  39.09 
 
 		 119 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  39.82 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  42.73 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  44.14 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  39.32 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0700  ribosome-binding factor A  40.35 
 
 		 119 aa  98.6  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00262073  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  43.64 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  42.24 
 
 		 141 aa  98.6  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  43.22 
 
 		 119 aa  98.6  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  44.14 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  38.6 
 
 		 131 aa  97.4  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 122 aa  97.8  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1354  ribosome-binding factor A  41.44 
 
 		 117 aa  97.4  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  42.98 
 
 		 120 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  44.64 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  42.48 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  38.18 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  41.28 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  42.48 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  42.34 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  41.07 
 
 		 129 aa  93.6  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  43.1 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  42.24 
 
 		 121 aa  90.1  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1445  ribosome-binding factor A  41.59 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.084347  normal  0.20066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2204  ribosome-binding factor A  42.34 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  34.48 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  40.35 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0818  ribosome-binding factor A  41.44 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  36.04 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  37.72 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  37.72 
 
 		 123 aa  87.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  41.23 
 
 		 133 aa  87.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  35.96 
 
 		 133 aa  87.4  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  39.66 
 
 		 122 aa  87.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  41.23 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0382  ribosome-binding factor A  38.46 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  38.89 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  38.89 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23440  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 154 aa  87  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.487539  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  34.48 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  42.48 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3347  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0384  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2135  ribosome-binding factor A  40.57 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0168697  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2707  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.150572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  39.45 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1477  ribosome-binding factor A  37.14 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1021  ribosome-binding factor A  37.14 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1501  ribosome-binding factor A  37.14 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236636  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1290  ribosome-binding factor A  39.05 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1124  ribosome-binding factor A  38.79 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.559774  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 123 aa  84.3  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  37.39 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  35.96 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4642  ribosome-binding factor A  39.29 
 
 		 132 aa  84.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0378959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  41.74 
 
 		 130 aa  83.6  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  38.39 
 
 		 117 aa  84  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1020  ribosome-binding factor A  38.39 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  41.23 
 
 		 123 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  37.93 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  37.27 
 
 		 156 aa  83.6  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1423  ribosome-binding factor A  35.24 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.02264 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1226  ribosome-binding factor A  37.96 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.333897  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  38.26 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>