More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0818 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0818  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 119 aa  240  5e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0384  ribosome-binding factor A  66.38 
 
 		 117 aa  164  5e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0382  ribosome-binding factor A  62.83 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0700  ribosome-binding factor A  57.02 
 
 		 119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00262073  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1354  ribosome-binding factor A  47.37 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0434  ribosome-binding factor A  48.72 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  52.54 
 
 		 116 aa  110  9e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  47.17 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  44.64 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  44.64 
 
 		 116 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 118 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 118 aa  97.1  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 118 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  39.64 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  40.91 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  40.91 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  40.91 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  40.91 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  38.74 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  40.91 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  40.91 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  41.44 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  35.96 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  36.28 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  39.64 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 118 aa  84.3  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  38.18 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  38.1 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1124  ribosome-binding factor A  39.47 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.559774  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  37.14 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  38.32 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  37.14 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  39.62 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  39.25 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  36.11 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  39.29 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  37.27 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  38.46 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  34.91 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 116 aa  76.6  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 116 aa  76.6  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  32.08 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  36.04 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  35.51 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  37.96 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1445  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.084347  normal  0.20066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2027  ribosome-binding factor A  35.96 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.373244  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  36.67 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1748  ribosome-binding factor A  35.24 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0187668  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1511  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.898255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  34.21 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  32.71 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  36.44 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  39.81 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  34.48 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  34.48 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2118  Ribosome-binding factor A-like protein  34.26 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.376562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  39.81 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2030  ribosome-binding factor A  35.09 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0111953  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  40.37 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1427  ribosome-binding factor A  34.23 
 
 		 175 aa  73.6  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000533542 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  32.38 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2707  ribosome-binding factor A  38.32 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.150572 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  37.74 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  32.17 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3189  ribosome-binding factor A  36.79 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0454193  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1477  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0630  ribosome-binding factor A  35.04 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1021  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2814  ribosome-binding factor A  32.76 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1501  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236636  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  32.17 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  37.14 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  32.17 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3033  ribosome-binding factor A  39.45 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000370905  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  34.45 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  34.45 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1417  ribosome-binding factor A  32.14 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0421454  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3964  ribosome-binding factor A  32.73 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0780  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2135  ribosome-binding factor A  34.29 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0168697  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4642  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0378959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  30.83 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1633  ribosome-binding factor A  35.24 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100642  hitchhiker  0.000771704 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  36.28 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1314  ribosome-binding factor A  35.78 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1423  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.02264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>