More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2819 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  100 
 
 
123 aa  251  3e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  99.19 
 
 
123 aa  249  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  46.34 
 
 
125 aa  120  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  48.41 
 
 
138 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  48.82 
 
 
128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  46.83 
 
 
138 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  48 
 
 
126 aa  117  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  48.36 
 
 
133 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  48.76 
 
 
129 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  46.46 
 
 
129 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  53.57 
 
 
131 aa  114  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  46.09 
 
 
129 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  47.24 
 
 
132 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  47.24 
 
 
132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  47.24 
 
 
132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  47.24 
 
 
132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  45.24 
 
 
130 aa  110  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  45.45 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  43.2 
 
 
127 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  46.85 
 
 
147 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  43.8 
 
 
141 aa  104  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  42.98 
 
 
126 aa  103  8e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  44.09 
 
 
129 aa  103  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1211  ribosome-binding factor A  48.25 
 
 
123 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1118  ribosome-binding factor A  48.25 
 
 
123 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  0.630529 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  45.54 
 
 
123 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1290  ribosome-binding factor A  47.37 
 
 
123 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1754  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 
132 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0297721 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1031  ribosome-binding factor A  40.5 
 
 
146 aa  101  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.571877  hitchhiker  0.000026303 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1027  ribosome-binding factor A  40.5 
 
 
146 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000106496 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1092  ribosome-binding factor A  40.5 
 
 
146 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0591977 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  42.28 
 
 
136 aa  100  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1205  ribosome-binding factor A  40.5 
 
 
147 aa  100  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2027  ribosome-binding factor A  44.74 
 
 
122 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.373244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 
118 aa  99.8  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2707  ribosome-binding factor A  44.17 
 
 
128 aa  99.4  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.150572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0991  ribosome-binding factor A  42.61 
 
 
143 aa  99.4  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  40.6 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  40.6 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  40.6 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  41.35 
 
 
133 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  41.35 
 
 
133 aa  99  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  41.35 
 
 
133 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  41.35 
 
 
133 aa  99  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  41.35 
 
 
133 aa  99  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  41.35 
 
 
133 aa  99  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  41.35 
 
 
133 aa  99  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1748  ribosome-binding factor A  44.92 
 
 
126 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0187668  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  41.35 
 
 
133 aa  99  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  41.35 
 
 
133 aa  99  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1423  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 
132 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.02264 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  39.85 
 
 
133 aa  97.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1008  ribosome-binding factor A  42.61 
 
 
142 aa  97.8  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211982  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1383  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 
132 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2204  ribosome-binding factor A  39.02 
 
 
142 aa  97.4  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1477  ribosome-binding factor A  43.48 
 
 
132 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2030  ribosome-binding factor A  41.74 
 
 
123 aa  97.4  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0111953  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1021  ribosome-binding factor A  43.48 
 
 
132 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1501  ribosome-binding factor A  43.48 
 
 
132 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 
118 aa  97.1  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  43.75 
 
 
124 aa  97.1  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0962  ribosome-binding factor A  42.61 
 
 
137 aa  97.1  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.394859  normal  0.0786715 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2563  ribosome-binding factor A  43.86 
 
 
122 aa  97.1  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1060  ribosome-binding factor A  43.86 
 
 
122 aa  95.9  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00435559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1916  ribosome-binding factor A  43.86 
 
 
122 aa  95.9  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  39.69 
 
 
132 aa  96.3  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3642  ribosome-binding factor A  39.85 
 
 
133 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1226  ribosome-binding factor A  40.35 
 
 
122 aa  95.5  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.333897  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1741  ribosome-binding factor A  43.86 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4642  ribosome-binding factor A  44.86 
 
 
132 aa  95.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0378959  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0174  ribosome-binding factor A  43.86 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0246509  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1763  ribosome-binding factor A  43.86 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1506  ribosome-binding factor A  43.86 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0992  ribosome-binding factor A  43.86 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197459  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3474  ribosome-binding factor A  39.1 
 
 
133 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1728  ribosome-binding factor A  43.86 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403197  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3347  ribosome-binding factor A  39.1 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  38.79 
 
 
132 aa  94  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  37.19 
 
 
132 aa  94  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  39.82 
 
 
116 aa  94  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0070  ribosome-binding factor A  42.61 
 
 
134 aa  93.6  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.196892  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0490  ribosome-binding factor A  38.81 
 
 
136 aa  93.6  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1092  ribosome-binding factor A  40.17 
 
 
122 aa  93.2  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.378347  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0158  ribosome-binding factor A  40.62 
 
 
140 aa  93.6  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2749  ribosome-binding factor A  42.11 
 
 
123 aa  92.8  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2135  ribosome-binding factor A  43.69 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0168697  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  39.67 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  40 
 
 
121 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2819  ribosome-binding factor A  42.98 
 
 
121 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00171915  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0075  ribosome-binding factor A  41.74 
 
 
134 aa  92.8  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.122288  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  39.67 
 
 
132 aa  92  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  38.21 
 
 
133 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1633  ribosome-binding factor A  44.86 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100642  hitchhiker  0.000771704 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  38.79 
 
 
119 aa  91.3  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  38.79 
 
 
119 aa  91.3  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  35.54 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1696  ribosome-binding factor A  41.88 
 
 
138 aa  90.5  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  39.83 
 
 
127 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  37.82 
 
 
123 aa  90.1  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3994  ribosome-binding factor A  38.33 
 
 
136 aa  90.1  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.405974  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>