More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2049 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 127 aa  255  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  91.07 
 
 		 126 aa  206  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  76.99 
 
 		 118 aa  176  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  76.99 
 
 		 118 aa  176  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  76.99 
 
 		 118 aa  176  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  76.11 
 
 		 118 aa  176  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  76.11 
 
 		 118 aa  176  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  74.34 
 
 		 118 aa  173  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  74.34 
 
 		 118 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  73.45 
 
 		 118 aa  170  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  72.57 
 
 		 118 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  73.45 
 
 		 118 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  73.45 
 
 		 118 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  60.18 
 
 		 116 aa  154  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  60.18 
 
 		 116 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  60.18 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  53.57 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  54.21 
 
 		 122 aa  130  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  54.05 
 
 		 125 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  46.77 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  49.12 
 
 		 120 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  50.91 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  47.06 
 
 		 123 aa  118  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  52.25 
 
 		 132 aa  117  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  44.72 
 
 		 121 aa  117  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  54.63 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1511  ribosome-binding factor A  48.65 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.898255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  45.13 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  43.9 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  45.05 
 
 		 119 aa  114  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  43.86 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  48.18 
 
 		 119 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  49.07 
 
 		 117 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  44.14 
 
 		 119 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  45.37 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  45.38 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  45.83 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  44 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  47.97 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  41.32 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  44.8 
 
 		 138 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  42.5 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  42.98 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  47.75 
 
 		 116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  47.75 
 
 		 116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  44.44 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  42.15 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1445  ribosome-binding factor A  43.24 
 
 		 171 aa  107  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.084347  normal  0.20066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  42.74 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  43.59 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1212  ribosome-binding factor A  49.02 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.316878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  41.59 
 
 		 122 aa  104  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  42.2 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  40.48 
 
 		 141 aa  103  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  43.75 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  43.12 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  41.07 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  42.34 
 
 		 132 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0780  ribosome-binding factor A  48.08 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  42.74 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  39.82 
 
 		 117 aa  100  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  39.17 
 
 		 132 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23440  ribosome-binding factor A  44.23 
 
 		 154 aa  100  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.487539  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  36.43 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  39.2 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  35.48 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10330  ribosome-binding factor A  45.37 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.150571  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1143  ribosome-binding factor A  39.47 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0700  ribosome-binding factor A  46.3 
 
 		 119 aa  99.4  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00262073  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  41.53 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2118  Ribosome-binding factor A-like protein  38.4 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.376562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  37.29 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  42.2 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  36.59 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1020  ribosome-binding factor A  41.51 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  45.28 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  39.5 
 
 		 126 aa  97.4  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3680  ribosome-binding factor A  41.44 
 
 		 127 aa  97.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00259102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  42.98 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  43.12 
 
 		 122 aa  97.1  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  40.16 
 
 		 132 aa  97.1  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  40.98 
 
 		 132 aa  95.9  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  40.18 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  34.68 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0818  ribosome-binding factor A  39.64 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1354  ribosome-binding factor A  40.18 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1124  ribosome-binding factor A  45.79 
 
 		 121 aa  94.7  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.559774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0490  ribosome-binding factor A  38.1 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1427  ribosome-binding factor A  42.45 
 
 		 175 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000533542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  39.47 
 
 		 129 aa  94.4  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  39.82 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1131  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0305445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3347  ribosome-binding factor A  39.17 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0384  ribosome-binding factor A  38.79 
 
 		 117 aa  94  7e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  39.84 
 
 		 123 aa  93.6  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  41.46 
 
 		 132 aa  93.6  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>