More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1354 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1354  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 117 aa  237  4e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0700  ribosome-binding factor A  66.97 
 
 		 119 aa  155  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00262073  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0382  ribosome-binding factor A  50.44 
 
 		 122 aa  126  8.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0818  ribosome-binding factor A  47.37 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0384  ribosome-binding factor A  47.37 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0434  ribosome-binding factor A  44.83 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  46.02 
 
 		 123 aa  107  5e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  43.64 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 118 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 118 aa  98.6  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 118 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 118 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  41.44 
 
 		 117 aa  97.4  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  40.18 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  40.18 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  40.18 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  40.18 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  40.35 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07020  ribosome-binding factor A  43.24 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 159 aa  92  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  40.37 
 
 		 122 aa  92.8  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  40.35 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 119 aa  89.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  36.7 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  38.39 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1427  ribosome-binding factor A  40.18 
 
 		 175 aa  88.6  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000533542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1417  ribosome-binding factor A  41.59 
 
 		 169 aa  89  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0421454  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  39.45 
 
 		 131 aa  88.6  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  35.78 
 
 		 119 aa  88.2  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  41.53 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  41.38 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  36.61 
 
 		 118 aa  86.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  38.39 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  41.53 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  36.28 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  34.82 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  34.82 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  36.79 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  40.83 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  40.83 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  38.14 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1124  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.559774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  40.83 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0780  ribosome-binding factor A  43.36 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  39.83 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1445  ribosome-binding factor A  38.6 
 
 		 171 aa  80.1  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.084347  normal  0.20066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2315  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 163 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0767134 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  37.14 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  40.57 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  37.93 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1511  ribosome-binding factor A  39.09 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.898255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  40.57 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  39.81 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2135  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0168697  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  36.75 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1131  ribosome-binding factor A  37.72 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0305445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  36.44 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  38.26 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2010  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142179  normal  0.57147 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  33.91 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  33.91 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  32.46 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  37.27 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4038  ribosome-binding factor A  38.05 
 
 		 168 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.432163 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10330  ribosome-binding factor A  39.81 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.150571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  38.89 
 
 		 118 aa  76.6  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  36.84 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2749  ribosome-binding factor A  35.78 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0327  ribosome-binding factor A  36.13 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23440  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.487539  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3033  ribosome-binding factor A  35.04 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000370905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  35.19 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  34.21 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2991  ribosome-binding factor A  34.23 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0708502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  37.14 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3560  ribosome-binding factor A  40.91 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466003  normal  0.834335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3189  ribosome-binding factor A  35.59 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0454193  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1212  ribosome-binding factor A  41.51 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.316878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3752  ribosome-binding factor A  35.96 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00104734  unclonable  0.0000134979 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1423  ribosome-binding factor A  34.55 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.02264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1383  ribosome-binding factor A  34.55 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4642  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0378959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1021  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1501  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236636  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1477  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2748  ribosome-binding factor A  37.96 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131099  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  35.96 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>