More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A3909 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  100 
 
 
118 aa  235  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  100 
 
 
118 aa  235  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  100 
 
 
118 aa  235  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  96.61 
 
 
118 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  96.61 
 
 
118 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  96.61 
 
 
118 aa  230  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  95.76 
 
 
118 aa  228  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  95.76 
 
 
118 aa  228  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  95.76 
 
 
118 aa  227  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  95.76 
 
 
118 aa  227  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  94.92 
 
 
118 aa  226  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  81.08 
 
 
126 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  76.99 
 
 
127 aa  176  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  55.75 
 
 
116 aa  144  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  56.36 
 
 
130 aa  141  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  56.36 
 
 
116 aa  141  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  53.21 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  54.46 
 
 
118 aa  128  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  54.21 
 
 
122 aa  126  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  48.18 
 
 
119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  50.43 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  52.25 
 
 
120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  51.33 
 
 
119 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  48.7 
 
 
119 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  49.12 
 
 
121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  49.56 
 
 
123 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  52.29 
 
 
122 aa  114  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  52.73 
 
 
119 aa  114  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  50.45 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  51.38 
 
 
133 aa  111  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  46.36 
 
 
121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  46.73 
 
 
118 aa  110  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  46.02 
 
 
118 aa  110  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  47.37 
 
 
117 aa  110  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  41.53 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  42.59 
 
 
122 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  45.45 
 
 
119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 
117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  48.08 
 
 
156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  44.55 
 
 
119 aa  107  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  43.59 
 
 
123 aa  107  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  47.27 
 
 
116 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  47.27 
 
 
116 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  46.02 
 
 
139 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  46.02 
 
 
138 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  47.22 
 
 
131 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  45.13 
 
 
138 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  46.36 
 
 
136 aa  105  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  46.6 
 
 
121 aa  104  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  46.85 
 
 
127 aa  104  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  45.19 
 
 
129 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  44.64 
 
 
132 aa  104  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  45.45 
 
 
128 aa  103  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 
124 aa  103  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  43.59 
 
 
137 aa  102  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  45.3 
 
 
131 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3347  ribosome-binding factor A  43.75 
 
 
143 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0700  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 
119 aa  101  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00262073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  43.4 
 
 
132 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 
134 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  43.4 
 
 
132 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  43.75 
 
 
132 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1511  ribosome-binding factor A  49.45 
 
 
144 aa  101  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.898255  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  43.4 
 
 
132 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  43.4 
 
 
132 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  43.97 
 
 
122 aa  100  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  40 
 
 
147 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  42.45 
 
 
159 aa  100  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  44.64 
 
 
132 aa  100  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  43.97 
 
 
133 aa  98.6  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 
138 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  40.91 
 
 
141 aa  99.4  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  40.91 
 
 
126 aa  99  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  42.24 
 
 
126 aa  99.4  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  44.83 
 
 
132 aa  99.4  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1143  ribosome-binding factor A  42.06 
 
 
122 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4215  ribosome-binding factor A  40.18 
 
 
123 aa  96.7  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0306353 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  42.73 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0490  ribosome-binding factor A  40.52 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3680  ribosome-binding factor A  39.82 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00259102  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03395  ribosome-binding factor A  42.24 
 
 
137 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0818  ribosome-binding factor A  40.91 
 
 
119 aa  95.5  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1354  ribosome-binding factor A  40.18 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  39.82 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  37.29 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002610  ribosome-binding factor A  41.38 
 
 
131 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  38.68 
 
 
133 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  42.06 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1020  ribosome-binding factor A  41.51 
 
 
153 aa  94.4  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1212  ribosome-binding factor A  47.25 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.316878  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3595  ribosome-binding factor A  38.79 
 
 
136 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000837981  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3994  ribosome-binding factor A  38.79 
 
 
136 aa  94.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.405974  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  40.17 
 
 
129 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3729  ribosome-binding factor A  38.79 
 
 
136 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0092978  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1092  ribosome-binding factor A  41.03 
 
 
146 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0591977 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  39.45 
 
 
123 aa  94  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>