More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1670 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 123 aa  251  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  66.95 
 
 		 122 aa  168  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  60.5 
 
 		 122 aa  157  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  58.12 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  58.12 
 
 		 119 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  58.12 
 
 		 119 aa  144  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  48.74 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  52.17 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  44.95 
 
 		 126 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  44.63 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  40.65 
 
 		 131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  45.05 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  43.59 
 
 		 118 aa  107  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  43.59 
 
 		 118 aa  107  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  43.59 
 
 		 118 aa  107  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  44.86 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  46.02 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  44.86 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  43.93 
 
 		 118 aa  104  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  43.93 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  43.93 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  43.93 
 
 		 118 aa  104  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  42.2 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  41.88 
 
 		 118 aa  103  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  41.88 
 
 		 118 aa  103  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  44.54 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  42.98 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3033  ribosome-binding factor A  45.54 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000370905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  41.59 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  43.86 
 
 		 119 aa  100  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  42.24 
 
 		 119 aa  100  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  45.54 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  45.3 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  44.64 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  38.71 
 
 		 136 aa  96.7  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  42.15 
 
 		 123 aa  94.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  37.93 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 116 aa  93.6  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  42.61 
 
 		 127 aa  93.6  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  39.32 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  34.23 
 
 		 130 aa  92  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  34.23 
 
 		 116 aa  92  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  39.42 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  41.07 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 126 aa  89.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  39.45 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  39.32 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  39.32 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 147 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1020  ribosome-binding factor A  44.04 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1354  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3189  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 162 aa  87.8  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0454193  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  37.96 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23440  ribosome-binding factor A  39.45 
 
 		 154 aa  87  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.487539  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2118  Ribosome-binding factor A-like protein  37.84 
 
 		 160 aa  87  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.376562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0700  ribosome-binding factor A  41.44 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00262073  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  36.22 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  39.82 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  38.46 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  36.7 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  37.84 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  39.64 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  33.05 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  38.26 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  39.09 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1143  ribosome-binding factor A  34.55 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  39.09 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  39.09 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  37.27 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  40.2 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1184  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.352255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1131  ribosome-binding factor A  35.59 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0305445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  39.25 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  38.74 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  41.12 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2707  ribosome-binding factor A  36.59 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.150572 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1329  ribosome-binding factor A  37.25 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  33.61 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1511  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.898255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1445  ribosome-binding factor A  37.96 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.084347  normal  0.20066 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4215  ribosome-binding factor A  36.04 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0306353 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10330  ribosome-binding factor A  38.53 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.150571  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0382  ribosome-binding factor A  39.29 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3642  ribosome-binding factor A  38.18 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  35.2 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  34.68 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3474  ribosome-binding factor A  38.18 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2204  ribosome-binding factor A  37.19 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  35.29 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0384  ribosome-binding factor A  38.89 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  37.27 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  34.86 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  37.27 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  34.86 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  39.25 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  37.27 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  37.27 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>