185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0327 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0327  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 116 aa  230  4.0000000000000004e-60  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1354  ribosome-binding factor A  36.13 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0384  ribosome-binding factor A  31.62 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0382  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  32.41 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0172  ribosome-binding factor A  31.93 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.562977  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0991  ribosome-binding factor A  34.91 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00061052  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0818  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0132  ribosome-binding factor A  31.09 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0150  ribosome-binding factor A  31.09 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0611436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1310  ribosome-binding factor A  31.25 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.03706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  31.53 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0223  ribosome-binding factor A  30.77 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.120167  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  30.63 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  32.41 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  33.62 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0434  ribosome-binding factor A  27.83 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  31.3 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3752  ribosome-binding factor A  28.7 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00104734  unclonable  0.0000134979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1131  ribosome-binding factor A  29.91 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0305445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1496  ribosome-binding factor A  33.05 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.107589  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  27.19 
 
 		 116 aa  57  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  30.36 
 
 		 122 aa  57  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  34.55 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  28.07 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  28.7 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  28.7 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0700  ribosome-binding factor A  27.87 
 
 		 119 aa  57  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00262073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  28.7 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  27.78 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  27.78 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1744  ribosome-binding factor A  27.83 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  27.03 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  31.3 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2315  ribosome-binding factor A  29.66 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  27.03 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  27.03 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  29.91 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1678  ribosome-binding factor A  28.7 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00355813  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  27.03 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  26.09 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  28.85 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  27.03 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3046  ribosome-binding factor A  33.75 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1492  ribosome-binding factor A  32.48 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000665731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  29.82 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1105  ribosome-binding factor A  33.91 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.657587  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  32.04 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0356  ribosome-binding factor A  29.82 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.186334  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0923  ribosome-binding factor A  28.04 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.816784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3680  ribosome-binding factor A  25.23 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00259102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0780  ribosome-binding factor A  29.82 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3629  ribosome-binding factor A  38.64 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  29.17 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  27.97 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08030  ribosome-binding factor A  32.29 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.536354  normal  0.36831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3964  ribosome-binding factor A  27.73 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3560  ribosome-binding factor A  32.5 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466003  normal  0.834335 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  25.89 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  25.89 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  33.96 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  33.96 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0998  ribosome-binding factor A  37.18 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00108919  normal  0.25507 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  26.79 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  29.06 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  27.5 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  27.03 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07020  ribosome-binding factor A  28.45 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2416  ribosome-binding factor A  29.47 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01304  ribosome-binding factor A  32.89 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.435847  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  30.7 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  29.57 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4166  ribosome-binding factor A  37.35 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000106795  hitchhiker  0.00000000804111 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  29.57 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  26.27 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  34.65 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  27.35 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4876  ribosome-binding factor A  36.84 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.26776 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  32.43 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1427  ribosome-binding factor A  27.59 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000533542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1046  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2153  ribosome-binding factor A  28.21 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10459  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  26.47 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0158  ribosome-binding factor A  26.32 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1445  ribosome-binding factor A  26.89 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.084347  normal  0.20066 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  26.73 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1417  ribosome-binding factor A  31.93 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0421454  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2071  ribosome-binding factor A  34.67 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.573719 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  29.66 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0769  ribosome-binding factor A  31.73 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  24.35 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2294  ribosome-binding factor A  29.2 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.121706 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  25.23 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  27.43 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  27.43 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  26.26 
 
 		 119 aa  47.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0286  ribosome-binding factor A  27.78 
 
 		 184 aa  47  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3851  ribosome-binding factor A  28.7 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.258524  normal  0.192536 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>