288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0434 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0434  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 121 aa  247  3e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1354  ribosome-binding factor A  44.83 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0818  ribosome-binding factor A  48.72 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0384  ribosome-binding factor A  49.11 
 
 		 117 aa  115  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0700  ribosome-binding factor A  46.28 
 
 		 119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00262073  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0382  ribosome-binding factor A  47.75 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  39.82 
 
 		 123 aa  102  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  40.74 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  36.79 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  36.79 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  38.05 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  36.84 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  36.61 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  32.23 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3033  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000370905  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  35.19 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2027  ribosome-binding factor A  34.23 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.373244  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  35.54 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2030  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0111953  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  36.21 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  37.39 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  36.21 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  34.23 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  34.26 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  35.77 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  35.78 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1124  ribosome-binding factor A  35.34 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.559774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  33.91 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  33.91 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  34.58 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  28.83 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1021  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1501  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236636  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  30.63 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1477  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2010  ribosome-binding factor A  30.09 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142179  normal  0.57147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  37.74 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  35.45 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  28.07 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2427  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.224227  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  37.74 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  31.9 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  28.07 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  36.61 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  36.79 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  32.08 
 
 		 117 aa  67  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1290  ribosome-binding factor A  31.09 
 
 		 123 aa  67  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4642  ribosome-binding factor A  32.17 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0378959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2563  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3680  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00259102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1383  ribosome-binding factor A  31.3 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1423  ribosome-binding factor A  31.3 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.02264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  30.25 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2118  Ribosome-binding factor A-like protein  33.33 
 
 		 160 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.376562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1763  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  32.41 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1060  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00435559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  30.25 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  28.3 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1506  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1916  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24329  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2135  ribosome-binding factor A  31.78 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0168697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1741  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0992  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197459  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0174  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0246509  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl371  ribosome-binding factor A  32.71 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.61579e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1754  ribosome-binding factor A  31.3 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0297721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2819  ribosome-binding factor A  34.75 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00171915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1118  ribosome-binding factor A  31.09 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  0.630529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1211  ribosome-binding factor A  31.09 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  30.25 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3560  ribosome-binding factor A  34.55 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466003  normal  0.834335 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1702  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000429225 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  29.41 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1633  ribosome-binding factor A  33.9 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100642  hitchhiker  0.000771704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2749  ribosome-binding factor A  30.51 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2560  ribosome-binding factor A  30.09 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1248  ribosome-binding factor A  30.09 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0261774  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2748  ribosome-binding factor A  31.19 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131099  normal  0.170197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>