293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2118 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2118  Ribosome-binding factor A-like protein  100 
 
 
160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.376562  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  69.43 
 
 
156 aa  206  8e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1063  ribosome-binding factor A  82.68 
 
 
164 aa  193  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0689148  normal  0.0406746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3189  ribosome-binding factor A  61.73 
 
 
162 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0454193  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0780  ribosome-binding factor A  72.99 
 
 
151 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10330  ribosome-binding factor A  59.59 
 
 
169 aa  176  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.150571  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3590  ribosome-binding factor A  67.12 
 
 
147 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0900161  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1511  ribosome-binding factor A  61.43 
 
 
144 aa  175  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.898255  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1020  ribosome-binding factor A  58.67 
 
 
153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23440  ribosome-binding factor A  60 
 
 
154 aa  170  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.487539  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3560  ribosome-binding factor A  60 
 
 
168 aa  169  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466003  normal  0.834335 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1212  ribosome-binding factor A  60.58 
 
 
147 aa  167  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.316878  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1184  ribosome-binding factor A  60 
 
 
189 aa  167  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.352255 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1513  ribosome-binding factor A  64.93 
 
 
150 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.121246  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1445  ribosome-binding factor A  61.03 
 
 
171 aa  161  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.084347  normal  0.20066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3964  ribosome-binding factor A  57.78 
 
 
171 aa  155  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  63.43 
 
 
159 aa  151  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1329  ribosome-binding factor A  51.68 
 
 
156 aa  149  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1372  ribosome-binding factor A  51.03 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.589597  normal  0.116766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7740  ribosome-binding factor A  59.56 
 
 
152 aa  144  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14590  ribosome-binding factor A  58.96 
 
 
153 aa  142  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0231222  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2315  ribosome-binding factor A  47.06 
 
 
163 aa  141  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0767134 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4038  ribosome-binding factor A  49.32 
 
 
168 aa  140  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.432163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5832  ribosome-binding factor A  57.97 
 
 
149 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.154912  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1427  ribosome-binding factor A  58.96 
 
 
175 aa  137  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000533542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1417  ribosome-binding factor A  58.21 
 
 
169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0421454  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11490  ribosome-binding factor A  51.47 
 
 
143 aa  137  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871158  normal  0.911894 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07020  ribosome-binding factor A  51.75 
 
 
148 aa  136  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2066  ribosome-binding factor A  52.9 
 
 
171 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0366548  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2083  ribosome-binding factor A  52.9 
 
 
171 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2129  ribosome-binding factor A  52.9 
 
 
171 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.0220711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1717  ribosome-binding factor A  48.68 
 
 
157 aa  127  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.264807  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2153  ribosome-binding factor A  45.64 
 
 
151 aa  125  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10459  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1744  ribosome-binding factor A  48.2 
 
 
157 aa  121  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1451  ribosome-binding factor A  50.71 
 
 
145 aa  118  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10477  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2209  ribosome-binding factor A  49.64 
 
 
193 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000323925  decreased coverage  0.000414746 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0286  ribosome-binding factor A  46.04 
 
 
184 aa  111  5e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  38.74 
 
 
119 aa  100  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  38.74 
 
 
119 aa  100  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  38.4 
 
 
127 aa  98.2  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  37.74 
 
 
122 aa  97.8  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12853  ribosome-binding factor A  52.42 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.73354e-17  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  36.04 
 
 
131 aa  94.4  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  35.65 
 
 
116 aa  94  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  39.62 
 
 
118 aa  94  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  39.62 
 
 
118 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  39.42 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  42.59 
 
 
121 aa  92.8  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  37.74 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  39.62 
 
 
118 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  39.62 
 
 
118 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  39.62 
 
 
118 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  39.62 
 
 
118 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  39.62 
 
 
118 aa  92.8  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  39.62 
 
 
118 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  39.42 
 
 
118 aa  92  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  39.42 
 
 
118 aa  92  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  33.91 
 
 
130 aa  92  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  33.91 
 
 
116 aa  92  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  39.62 
 
 
118 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 
120 aa  91.3  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  34.82 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  36.11 
 
 
125 aa  89  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  37.74 
 
 
118 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  37.07 
 
 
124 aa  88.2  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  37.72 
 
 
129 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  37.84 
 
 
123 aa  87.4  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  36.11 
 
 
119 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1124  ribosome-binding factor A  38.05 
 
 
121 aa  87  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.559774  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  36.11 
 
 
122 aa  85.1  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  43.48 
 
 
119 aa  84.7  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  33.08 
 
 
123 aa  84.7  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3347  ribosome-binding factor A  36.84 
 
 
143 aa  84.3  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  33.62 
 
 
118 aa  84  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  40.86 
 
 
119 aa  84  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  32.43 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  42.45 
 
 
123 aa  82  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  35.34 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  35.51 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  39.47 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  39.47 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  39.47 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  39.47 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  37.84 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  32.12 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  36.21 
 
 
116 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  36.21 
 
 
116 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  32.58 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  40.22 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2027  ribosome-binding factor A  37.84 
 
 
122 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.373244  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  34.23 
 
 
117 aa  79  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  35.38 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2030  ribosome-binding factor A  36.84 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0111953  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  37.93 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  37.19 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  34.21 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0700  ribosome-binding factor A  38.1 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00262073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>