247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl371 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl371  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 116 aa  228  3e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.61579e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0325  ribosome-binding factor A  50.45 
 
 		 117 aa  90.1  9e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.914264  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0434  ribosome-binding factor A  32.71 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  33 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  33 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1744  ribosome-binding factor A  34.58 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388944  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  28.32 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  31.68 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  31.68 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  31.68 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002610  ribosome-binding factor A  28.28 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  32.67 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  30.69 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  32.67 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  28.71 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  32.67 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  30.69 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  30.69 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2315  ribosome-binding factor A  34.74 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0767134 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  30.69 
 
 		 118 aa  57  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0175  ribosome-binding factor A  28.28 
 
 		 136 aa  57  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.146816  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03395  ribosome-binding factor A  27.36 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  30.69 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0058  ribosome-binding factor A  37.18 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  29.7 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2027  ribosome-binding factor A  32.35 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.373244  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  30.69 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  32.46 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  32.46 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  30.69 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  35.58 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4038  ribosome-binding factor A  33.68 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.432163 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  29.29 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  34.07 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0599  ribosome-binding factor A  26.26 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.369509  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  32.17 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  32.17 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0180  ribosome-binding factor A  31.63 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.708366  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3189  ribosome-binding factor A  29.79 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0454193  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1124  ribosome-binding factor A  31.37 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.559774  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2030  ribosome-binding factor A  32.35 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0111953  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  31.68 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1354  ribosome-binding factor A  29.57 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1290  ribosome-binding factor A  31.37 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  30.69 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1211  ribosome-binding factor A  30.39 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1118  ribosome-binding factor A  30.39 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  0.630529 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0204  ribosome-binding factor A  31.63 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  30.39 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2814  ribosome-binding factor A  32.04 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  27.18 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  34.34 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07020  ribosome-binding factor A  29.73 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  28.71 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  31.68 
 
 		 125 aa  52  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  34.26 
 
 		 122 aa  52  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  28.26 
 
 		 122 aa  52  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  28.16 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  27.66 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  30.69 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1027  ribosome-binding factor A  27.18 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106496 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1092  ribosome-binding factor A  27.18 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0591977 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0370  ribosome-binding factor A  35.96 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000258707  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  30.1 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0025  ribosome-binding factor A  30.85 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0490  ribosome-binding factor A  29.75 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4619  ribosome-binding factor A  32.94 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  26.72 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0601  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2922  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0301917  normal  0.0601013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2696  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.674256 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1205  ribosome-binding factor A  26.21 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  27.59 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  27.59 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  27.72 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0923  ribosome-binding factor A  34.29 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.816784 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  27.88 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0032  ribosome-binding factor A  30.85 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0818  ribosome-binding factor A  28.7 
 
 		 119 aa  50.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1031  ribosome-binding factor A  26.96 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.571877  hitchhiker  0.000026303 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0382  ribosome-binding factor A  30.77 
 
 		 122 aa  50.4  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01304  ribosome-binding factor A  27 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.435847  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 117 aa  50.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  29.41 
 
 		 129 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  27.83 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2563  ribosome-binding factor A  31.37 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2294  ribosome-binding factor A  25 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.121706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  31.52 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0991  ribosome-binding factor A  26.96 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0243  hypothetical protein  32.11 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  30.39 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  26.21 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  36 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  31.37 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  30.39 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2991  ribosome-binding factor A  30.69 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0708502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01261  ribosome-binding factor A  32.35 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0310075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>