242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_01261 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_01261  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 132 aa  262  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0310075  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01291  ribosome-binding factor A  72.87 
 
 		 130 aa  188  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.774457  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01301  ribosome-binding factor A  69.77 
 
 		 130 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.665223  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0115  ribosome-binding factor A  65.89 
 
 		 130 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  33.59 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  36.89 
 
 		 134 aa  100  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  36.89 
 
 		 130 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  32.82 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  36.75 
 
 		 142 aa  96.7  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  35.65 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  40.16 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  33.07 
 
 		 134 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  32.31 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  34.48 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  38.52 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  32.23 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  30.17 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  30.17 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  35.09 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  30.58 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  32.77 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  33.6 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  34.23 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  32.54 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  31.9 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  30.47 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  32.73 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  32.73 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  32.73 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  34.92 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  29.73 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  30.63 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  32.73 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  30.91 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  33.63 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  30.91 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  30.91 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  31.85 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  36.56 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  26.61 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1696  ribosome-binding factor A  33.62 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  26.32 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0991  ribosome-binding factor A  25.83 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0860  ribosome-binding factor A  34.74 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1105  ribosome-binding factor A  28.45 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.657587  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  34.23 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0368  ribosome-binding factor A  31.4 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159363  normal  0.435945 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03395  ribosome-binding factor A  31.5 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0490  ribosome-binding factor A  32.14 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  30.91 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3994  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.405974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3595  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000837981  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01761  ribosome-binding factor A  29.27 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.138056  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1008  ribosome-binding factor A  24.62 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211982  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3729  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0092978  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  24.17 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1205  ribosome-binding factor A  24.22 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8062  predicted protein  24.26 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00519858  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  29.01 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  26.09 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  26.09 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  29.41 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  29.01 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  23.89 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1027  ribosome-binding factor A  25.58 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106496 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  31.48 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  31.48 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  31.48 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2204  ribosome-binding factor A  27.48 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0175  ribosome-binding factor A  27.27 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.146816  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  27.12 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  31.48 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1461  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00371256  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002610  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  31.48 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  31.48 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0832  ribosome-binding factor A  32.23 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1092  ribosome-binding factor A  25.58 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0591977 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0955  ribosome-binding factor A  28.18 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.676636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  31.48 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  31.48 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1031  ribosome-binding factor A  25.58 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.571877  hitchhiker  0.000026303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  31.48 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3388  ribosome-binding factor A  27.1 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.990819  hitchhiker  0.00369045 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  24.26 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  29.63 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  31.36 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  31.36 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  23.02 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0072  ribosome-binding factor A  27.93 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  24.39 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  28.23 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  25.21 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>