224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0370 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0370  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 116 aa  230  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000258707  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1778  ribosome-binding factor A  70.18 
 
 		 119 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00495715  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0399  ribosome-binding factor A  72.57 
 
 		 119 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000842232  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0301  ribosome-binding factor A  68.1 
 
 		 119 aa  165  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0403  ribosome-binding factor A  70 
 
 		 116 aa  161  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000114311  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0368  ribosome-binding factor A  71.17 
 
 		 122 aa  158  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159363  normal  0.435945 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1461  ribosome-binding factor A  65.49 
 
 		 123 aa  147  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00371256  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1310  ribosome-binding factor A  43.52 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.03706  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0998  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00108919  normal  0.25507 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  38.05 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  35.09 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  35.09 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  37.07 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  36.21 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  36.21 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0781  ribosome-binding factor A  38.18 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  36.21 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  35.65 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  36.21 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  35.96 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  36.21 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  36.28 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  36.21 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  36.21 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  36.21 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4876  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.26776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2815  ribosome-binding factor A  34.21 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473664  hitchhiker  0.00211169 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  34.48 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  34.48 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3680  ribosome-binding factor A  34.21 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00259102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1131  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0305445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01761  ribosome-binding factor A  34.82 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.138056  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  32.77 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  38.14 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0923  ribosome-binding factor A  34.55 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.816784 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  34.48 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  33.93 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  37.39 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  33.63 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4166  ribosome-binding factor A  29.06 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000106795  hitchhiker  0.00000000804111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3752  ribosome-binding factor A  35.04 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00104734  unclonable  0.0000134979 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  36.04 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  33.05 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  35.4 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  31.62 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  35.04 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  35.04 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  35.04 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  35.04 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  36.75 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  31.3 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  35.04 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  35.04 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  34.48 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  35.04 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  35.04 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  35.04 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  31.53 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  31.53 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03395  ribosome-binding factor A  34.21 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1069  ribosome-binding factor A  31.48 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0955  ribosome-binding factor A  32.46 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.676636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0175  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.146816  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 139 aa  57  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002610  ribosome-binding factor A  34.23 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01261  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0310075  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03290  ribosome-binding factor A  34.74 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441975  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  33.63 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  29.31 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3629  ribosome-binding factor A  30.83 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  33.63 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  34.78 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2818  ribosome-binding factor A  32.14 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  31.58 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  30.17 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2922  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0301917  normal  0.0601013 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3726  ribosome-binding factor A  31.09 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2696  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.674256 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1696  ribosome-binding factor A  30.36 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01301  ribosome-binding factor A  27.59 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.665223  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  31.3 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0025  ribosome-binding factor A  34.15 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>