232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0955 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0955  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 125 aa  249  7e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.676636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2815  ribosome-binding factor A  33.06 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473664  hitchhiker  0.00211169 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  37.9 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  31.58 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  34.48 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0982  ribosome-binding factor A  30.77 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.385895  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  30.4 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_854  ribosome-binding factor A  29.91 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000358033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  31.03 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  32.31 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  34.68 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  31.03 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  34.58 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  34.58 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  34.58 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  30.17 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  34.58 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  33.93 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  32.46 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  32.26 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0873  ribosome-binding factor A  29.06 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01304  ribosome-binding factor A  34.23 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.435847  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  32.28 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1748  ribosome-binding factor A  36 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0187668  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  28.8 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  31.78 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  29.84 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  31.03 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  32.14 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  31.15 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  31.78 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  32.71 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  30.84 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2814  ribosome-binding factor A  32.8 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  33.86 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0204  ribosome-binding factor A  33.06 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2707  ribosome-binding factor A  31.01 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.150572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  29.75 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01261  ribosome-binding factor A  28.18 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0310075  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  34.82 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3726  ribosome-binding factor A  34.11 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  32.38 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  29.13 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  30.43 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  32 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  29.63 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  29.03 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  30.91 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0180  ribosome-binding factor A  32.26 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.708366  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  29.03 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1461  ribosome-binding factor A  32.54 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00371256  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0370  ribosome-binding factor A  32.46 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000258707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  29.09 
 
 		 119 aa  57  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  30.63 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8062  predicted protein  30.33 
 
 		 171 aa  57  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00519858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0319  ribosome-binding factor A  32.98 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2818  ribosome-binding factor A  32.03 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  31.48 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  30.91 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  29.92 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  27.64 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  30.08 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0399  ribosome-binding factor A  30.17 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000842232  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  33.06 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  29.09 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0860  ribosome-binding factor A  31.52 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  32.23 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2696  ribosome-binding factor A  31.25 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.674256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  31.53 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2922  ribosome-binding factor A  31.25 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0301917  normal  0.0601013 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  32.41 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  33.02 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03395  ribosome-binding factor A  30.56 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  31.43 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>