208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1069 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1069  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 130 aa  257  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0781  ribosome-binding factor A  60.16 
 
 		 130 aa  159  9e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03290  ribosome-binding factor A  56.15 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441975  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0923  ribosome-binding factor A  47.75 
 
 		 111 aa  107  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.816784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4876  ribosome-binding factor A  43.75 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.26776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0998  ribosome-binding factor A  40.17 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00108919  normal  0.25507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0393  ribosome-binding factor A  43.44 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3629  ribosome-binding factor A  38.39 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4166  ribosome-binding factor A  37.96 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000106795  hitchhiker  0.00000000804111 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  36.63 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  36.63 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0368  ribosome-binding factor A  35.19 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159363  normal  0.435945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  35.58 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0403  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000114311  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  34.65 
 
 		 133 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  34.26 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  34.26 
 
 		 118 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  34.26 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  34.26 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1310  ribosome-binding factor A  34.55 
 
 		 126 aa  66.6  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.03706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  34.26 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  34.26 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  32.14 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  34.26 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0180  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.708366  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  32.46 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1778  ribosome-binding factor A  34.55 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00495715  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  34.62 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0204  ribosome-binding factor A  36.11 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  32.41 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  32.41 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  35.96 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  32.41 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  32.69 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2814  ribosome-binding factor A  31.48 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01304  ribosome-binding factor A  35.35 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.435847  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0399  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000842232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  32 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  29.73 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  26.89 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  32.77 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  32.77 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  33.93 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  36.71 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0370  ribosome-binding factor A  30.91 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1461  ribosome-binding factor A  28.93 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00371256  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  30.56 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3782  ribosome-binding factor A  30.33 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0911878  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0746  ribosome-binding factor A  28.69 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321784  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  35.78 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  28.69 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  25.49 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0370  ribosome-binding factor A  31.48 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000258707  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  31.43 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  36.67 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  31.43 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  31.31 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  29.31 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  30.28 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2166  ribosome-binding factor A  28.69 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  32.35 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0818  ribosome-binding factor A  35.09 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01301  ribosome-binding factor A  28.35 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.665223  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  31.58 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2078  ribosome-binding factor A  28.69 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  30.36 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4619  ribosome-binding factor A  26.36 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3931  ribosome-binding factor A  31.58 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4066  ribosome-binding factor A  30.33 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  29 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  30.36 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01261  ribosome-binding factor A  34.69 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0310075  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2488  ribosome-binding factor A  30.83 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266682  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  26.67 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0025  ribosome-binding factor A  24.59 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  26.26 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01291  ribosome-binding factor A  29.29 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.774457  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4215  ribosome-binding factor A  28.44 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0306353 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  26.47 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0301  ribosome-binding factor A  27.78 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2799  ribosome-binding factor A  27.88 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285538  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  31.37 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4386  ribosome-binding factor A  30.33 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.4784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2922  ribosome-binding factor A  24.55 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0301917  normal  0.0601013 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2610  ribosome-binding factor A  25.45 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4036  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0481  ribosome-binding factor A  28.18 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214856  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0032  ribosome-binding factor A  25.41 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0170  ribosome-binding factor A  28.95 
 
 		 137 aa  52  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0610976  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2696  ribosome-binding factor A  24.55 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.674256 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  24.55 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3041  ribosome-binding factor A  28.97 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.603703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3442  ribosome-binding factor A  27.87 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.728771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>