258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2815 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2815  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 122 aa  244  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473664  hitchhiker  0.00211169 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  40.74 
 
 		 119 aa  90.1  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  36.84 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0955  ribosome-binding factor A  33.06 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.676636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  31.71 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  35.59 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  32.2 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  33.93 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  31.15 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  32.71 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  39.05 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  39.05 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  30.7 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  35.45 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0982  ribosome-binding factor A  30.17 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.385895  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0873  ribosome-binding factor A  30.17 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231797  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  34.68 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  34.58 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_854  ribosome-binding factor A  29.31 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000358033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  30.83 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  30.08 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  33.62 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2799  ribosome-binding factor A  37.01 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285538  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  33.62 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0399  ribosome-binding factor A  34.78 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000842232  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0370  ribosome-binding factor A  34.21 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000258707  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  31.19 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  31.25 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  31.48 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  32.17 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  31.25 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  33.61 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  31.25 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4036  ribosome-binding factor A  38.78 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  32.14 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  34.58 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  30.36 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  30.36 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  30.28 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1778  ribosome-binding factor A  34.26 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00495715  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  30.09 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  33.66 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  32.26 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  31.25 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3964  ribosome-binding factor A  32.91 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1106  ribosome-binding factor A  37.63 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0674  ribosome-binding factor A  32.48 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156226 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11490  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871158  normal  0.911894 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  34.43 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  31.71 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  34.21 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0301  ribosome-binding factor A  32.76 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2924  ribosome-binding factor A  36.56 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332986  normal  0.135151 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  29.27 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1020  ribosome-binding factor A  33.96 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  31.62 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0780  ribosome-binding factor A  32.08 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2768  ribosome-binding factor A  37.63 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1212  ribosome-binding factor A  37.8 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.316878  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  28.44 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  30.77 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0292  ribosome-binding factor A  34.86 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.887654  normal  0.0167928 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0613  ribosome-binding factor A  37.27 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.440259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0368  ribosome-binding factor A  34.55 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159363  normal  0.435945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3815  ribosome-binding factor A  35.78 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104911  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10330  ribosome-binding factor A  33.65 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.150571  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  26.77 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  34.82 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  30.63 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  30.1 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3629  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.445652  normal  0.0497582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  28.7 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  30.89 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  29.13 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0230  ribosome-binding factor A  35.43 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00202036  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  30.58 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0601  ribosome-binding factor A  36.7 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  34.02 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  33.93 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>