240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_01301 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_01301  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 130 aa  258  2e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.665223  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01291  ribosome-binding factor A  96.15 
 
 		 130 aa  247  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.774457  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0115  ribosome-binding factor A  86.92 
 
 		 130 aa  224  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01261  ribosome-binding factor A  69.77 
 
 		 132 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0310075  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  35.25 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  39.34 
 
 		 130 aa  106  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  36.07 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  35.2 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  35.83 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  33.07 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  36.84 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  36.13 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  40.87 
 
 		 123 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  33.86 
 
 		 133 aa  98.6  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  34.43 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  34.48 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  34.48 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  33.06 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  35.2 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  31.93 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  29.57 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  30.43 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  31.58 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  37.63 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  30.16 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0860  ribosome-binding factor A  35.42 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  32.73 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  32.43 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  32.48 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  30.17 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  32.73 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  26.02 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  32.23 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  26.56 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  25.19 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1696  ribosome-binding factor A  35.59 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  31.03 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  31.03 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  29.06 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  32.26 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8062  predicted protein  26.76 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00519858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  25.98 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  28.45 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0873  ribosome-binding factor A  24.77 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231797  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  26.85 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  30.36 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  31.19 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  31.19 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03395  ribosome-binding factor A  32.81 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  24.35 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  24.35 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  24.17 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  25 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  31.19 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0175  ribosome-binding factor A  30.95 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.146816  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  26.92 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1020  ribosome-binding factor A  33.65 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01761  ribosome-binding factor A  29.51 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.138056  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002610  ribosome-binding factor A  31.5 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0368  ribosome-binding factor A  31.15 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159363  normal  0.435945 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  31.19 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0991  ribosome-binding factor A  27.97 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  30.25 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_854  ribosome-binding factor A  25 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000358033  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0982  ribosome-binding factor A  25 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.385895  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1069  ribosome-binding factor A  28.35 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  31.19 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  31.19 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0319  ribosome-binding factor A  30.85 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01304  ribosome-binding factor A  31.37 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.435847  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  23.81 
 
 		 129 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0301  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1105  ribosome-binding factor A  26.55 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.657587  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1314  ribosome-binding factor A  29.75 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0599  ribosome-binding factor A  29.37 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.369509  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  25.41 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  28 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  26.15 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1031  ribosome-binding factor A  30.51 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.571877  hitchhiker  0.000026303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  31.73 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  24.6 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  27.03 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1205  ribosome-binding factor A  29.13 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  24.43 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  24.81 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2814  ribosome-binding factor A  26.67 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1027  ribosome-binding factor A  28.7 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>