More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_8062 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009361  OSTLU_8062  predicted protein  100 
 
 		 171 aa  344  3e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00519858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 123 aa  93.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  39.67 
 
 		 118 aa  91.3  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  39.67 
 
 		 118 aa  91.3  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  39.67 
 
 		 118 aa  91.3  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  41.54 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  38.1 
 
 		 118 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  38.1 
 
 		 118 aa  89.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  38.1 
 
 		 118 aa  89  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  38.1 
 
 		 118 aa  89  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  37.3 
 
 		 118 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 134 aa  88.2  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  37.3 
 
 		 118 aa  87.8  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  38.02 
 
 		 118 aa  87.4  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  38.02 
 
 		 118 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  38.58 
 
 		 122 aa  87.8  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  39.53 
 
 		 132 aa  87  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  38.1 
 
 		 137 aa  85.5  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  40.18 
 
 		 147 aa  85.9  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  37.8 
 
 		 131 aa  84.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  33.87 
 
 		 117 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  36.84 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  38.02 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  35.16 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  36.22 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  36.22 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  36.07 
 
 		 122 aa  80.5  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  35.54 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  33.83 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1314  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03395  ribosome-binding factor A  34.11 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  32.52 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002610  ribosome-binding factor A  34.43 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  36.79 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  30.33 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  31.58 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  32.62 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  31.58 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  30.77 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  34.4 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  32.03 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0175  ribosome-binding factor A  33.61 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.146816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  30.53 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  30.77 
 
 		 138 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  30.77 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  31.45 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 123 aa  72  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 119 aa  72  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  34.96 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  34.96 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0599  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.369509  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0204  ribosome-binding factor A  31.97 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  33.87 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0490  ribosome-binding factor A  36.22 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  32.23 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3474  ribosome-binding factor A  32.52 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3642  ribosome-binding factor A  32.52 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  33.98 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0180  ribosome-binding factor A  31.97 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.708366  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1310  ribosome-binding factor A  32 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.03706  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  30.83 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2204  ribosome-binding factor A  30.3 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3729  ribosome-binding factor A  33.86 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0092978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3595  ribosome-binding factor A  33.86 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000837981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  35.77 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3994  ribosome-binding factor A  33.86 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.405974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  32.09 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  30.33 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  34.15 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01304  ribosome-binding factor A  43.37 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.435847  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  32.52 
 
 		 131 aa  67  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1696  ribosome-binding factor A  33.88 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  27.52 
 
 		 141 aa  67.4  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  28.79 
 
 		 133 aa  67  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  34.15 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0982  ribosome-binding factor A  30.33 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.385895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  37.18 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  26.19 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  34.15 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  26.19 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  31.45 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  27.42 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1748  ribosome-binding factor A  31.15 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0187668  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  26.98 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>