More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1314 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1314  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 119 aa  235  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  50.89 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0175  ribosome-binding factor A  48.31 
 
 		 136 aa  106  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.146816  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  46.85 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3595  ribosome-binding factor A  45.08 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000837981  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3994  ribosome-binding factor A  45.08 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.405974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  47.86 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  46.96 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3729  ribosome-binding factor A  45.08 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0092978  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03395  ribosome-binding factor A  47.46 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  46.15 
 
 		 133 aa  104  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002610  ribosome-binding factor A  47.75 
 
 		 131 aa  103  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0490  ribosome-binding factor A  43.44 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  49.51 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2204  ribosome-binding factor A  45.53 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  47.46 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  47.46 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  47.46 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  47.46 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  47.46 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0599  ribosome-binding factor A  45.95 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.369509  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3642  ribosome-binding factor A  47.46 
 
 		 133 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  47.46 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  47.46 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3474  ribosome-binding factor A  47.46 
 
 		 133 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  40.48 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  47.46 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  47.46 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  40.48 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  42.61 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2814  ribosome-binding factor A  46.02 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0991  ribosome-binding factor A  44.07 
 
 		 143 aa  98.6  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  40.48 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  40.48 
 
 		 132 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  51.92 
 
 		 130 aa  98.2  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1031  ribosome-binding factor A  44.92 
 
 		 146 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.571877  hitchhiker  0.000026303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  46.61 
 
 		 133 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  45.45 
 
 		 133 aa  97.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  46.61 
 
 		 133 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1027  ribosome-binding factor A  44.92 
 
 		 146 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106496 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1092  ribosome-binding factor A  44.92 
 
 		 146 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0591977 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  45.76 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  40.83 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1008  ribosome-binding factor A  44.14 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211982  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1205  ribosome-binding factor A  44.07 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0962  ribosome-binding factor A  43.59 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.394859  normal  0.0786715 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  44.34 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  39.17 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2707  ribosome-binding factor A  41.07 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.150572 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  36.61 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 133 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  38.74 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01761  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.138056  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  38.18 
 
 		 126 aa  89.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1696  ribosome-binding factor A  45 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  38.74 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  38.74 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  40.68 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  37.27 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  37.84 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0180  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.708366  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  37.84 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  37.84 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  37.84 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0204  ribosome-binding factor A  42.02 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  38.6 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  37.93 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  39.5 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3347  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  44.76 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  35.78 
 
 		 116 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  35.78 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2833  ribosome-binding factor A  44.63 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  35.19 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1129  ribosome-binding factor A  44.63 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0360009  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3238  ribosome-binding factor A  44.63 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3279  ribosome-binding factor A  44.63 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470781  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3416  ribosome-binding factor A  44.63 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.523215  hitchhiker  0.00061048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1310  ribosome-binding factor A  40.57 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.03706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  34.26 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01304  ribosome-binding factor A  44.66 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.435847  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  38.74 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2030  ribosome-binding factor A  38.53 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0111953  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1290  ribosome-binding factor A  36.11 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8062  predicted protein  38.98 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00519858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2027  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.373244  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  36.21 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3033  ribosome-binding factor A  36.21 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000370905  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1226  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.333897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>