299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0180 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0180  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 125 aa  251  3e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.708366  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0204  ribosome-binding factor A  98.4 
 
 		 125 aa  248  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2814  ribosome-binding factor A  68.8 
 
 		 127 aa  169  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01304  ribosome-binding factor A  71.82 
 
 		 115 aa  158  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.435847  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  46.28 
 
 		 125 aa  94.4  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0175  ribosome-binding factor A  40.94 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.146816  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002610  ribosome-binding factor A  39.52 
 
 		 131 aa  94  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03395  ribosome-binding factor A  39.52 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  40.32 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  44.64 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  37.8 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  39.23 
 
 		 133 aa  88.6  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1314  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 138 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  41.44 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  39.09 
 
 		 138 aa  87  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  40.91 
 
 		 123 aa  87  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  39.02 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  44.64 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  42.34 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  39.47 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  41.28 
 
 		 133 aa  84.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  37.8 
 
 		 132 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0599  ribosome-binding factor A  38.71 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.369509  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  37.6 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  39.09 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  39.09 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  36.89 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  37.84 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1008  ribosome-binding factor A  36.29 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211982  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  34.15 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  37.72 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  37.72 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  34.43 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  38.18 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  32.77 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3474  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3642  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  38.26 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  38.26 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3994  ribosome-binding factor A  32.84 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.405974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3729  ribosome-binding factor A  32.84 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0092978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3595  ribosome-binding factor A  32.84 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000837981  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1205  ribosome-binding factor A  35.48 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1092  ribosome-binding factor A  35.48 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0591977 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1027  ribosome-binding factor A  35.48 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106496 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  38.26 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  38.26 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  38.26 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  38.26 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  38.26 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  38.26 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  38.26 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  38.26 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  38.26 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1031  ribosome-binding factor A  34.68 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.571877  hitchhiker  0.000026303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  37.39 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01761  ribosome-binding factor A  34.4 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.138056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0490  ribosome-binding factor A  37.6 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  36.97 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  35.51 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  34.86 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  34.86 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  33.61 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  33.61 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  33.61 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0962  ribosome-binding factor A  37.1 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.394859  normal  0.0786715 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  36.28 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0991  ribosome-binding factor A  33.61 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1092  ribosome-binding factor A  37.27 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.378347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_854  ribosome-binding factor A  34.91 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000358033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  32.77 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  32.77 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3347  ribosome-binding factor A  32.2 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1748  ribosome-binding factor A  35.65 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0187668  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1290  ribosome-binding factor A  38.05 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  37.84 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0982  ribosome-binding factor A  35.85 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.385895  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1226  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.333897  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  30.83 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  30.28 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2204  ribosome-binding factor A  33.86 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  34.38 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8062  predicted protein  31.97 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00519858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  30.56 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  34.45 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  34.45 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  30.63 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0873  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>