242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_01291 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_01291  ribosome-binding factor A  100 
 
 
130 aa  256  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.774457  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01301  ribosome-binding factor A  96.15 
 
 
130 aa  247  3e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.665223  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0115  ribosome-binding factor A  87.69 
 
 
130 aa  226  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01261  ribosome-binding factor A  72.87 
 
 
132 aa  188  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0310075  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  35.25 
 
 
140 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  37.19 
 
 
134 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  37.7 
 
 
130 aa  103  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  33.86 
 
 
132 aa  101  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  36.07 
 
 
134 aa  100  8e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  33.86 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  34.4 
 
 
137 aa  99.4  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  35.83 
 
 
142 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  34.43 
 
 
131 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  38.21 
 
 
123 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  35.96 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  34.48 
 
 
128 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  34.48 
 
 
128 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  37.4 
 
 
123 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  34.71 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  31.93 
 
 
119 aa  77  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  34.4 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  28.45 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  30.43 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  37.63 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  29.75 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  32.43 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  26.83 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  32.73 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0860  ribosome-binding factor A  34.38 
 
 
102 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  33.06 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  30.17 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  30.17 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  34.86 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  35.4 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  32.5 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  32.5 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  32.5 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  29.91 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  32.73 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  31.9 
 
 
123 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1696  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 
118 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  31.9 
 
 
123 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  25.78 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8062  predicted protein  26.76 
 
 
171 aa  62.4  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00519858  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  28.21 
 
 
122 aa  61.6  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 
118 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03395  ribosome-binding factor A  33.59 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 
118 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  31.45 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 
118 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  30.83 
 
 
118 aa  60.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  30.83 
 
 
118 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  25.44 
 
 
121 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1105  ribosome-binding factor A  28.32 
 
 
132 aa  60.5  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.657587  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  28.21 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  28.21 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1020  ribosome-binding factor A  33.65 
 
 
153 aa  60.1  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  27.59 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  26.67 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  23.66 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0873  ribosome-binding factor A  24.77 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231797  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0368  ribosome-binding factor A  31.4 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159363  normal  0.435945 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  30.25 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  24.81 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  23.26 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0319  ribosome-binding factor A  31.91 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  29.46 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0175  ribosome-binding factor A  30.95 
 
 
136 aa  57.8  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.146816  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0991  ribosome-binding factor A  27.19 
 
 
143 aa  57.8  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01761  ribosome-binding factor A  32.2 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.138056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  31.19 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  25.62 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  31.19 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1031  ribosome-binding factor A  29.57 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.571877  hitchhiker  0.000026303 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  28.21 
 
 
118 aa  57  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1205  ribosome-binding factor A  29.57 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0466  ribosome-binding factor A  25.69 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002610  ribosome-binding factor A  30.71 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  25 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1027  ribosome-binding factor A  29.57 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000106496 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1092  ribosome-binding factor A  29.57 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0591977 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  23.85 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  31.73 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  29.37 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  29.37 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0982  ribosome-binding factor A  24.77 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.385895  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  25.56 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  29.37 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  29.37 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  25.56 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  29.37 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  29.37 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  29.37 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  25.21 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>