135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0243 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0243  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3629  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0998  ribosome-binding factor A  32.48 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00108919  normal  0.25507 
 
 
-
 
NC_002950  PG0923  ribosome-binding factor A  29 
 
 		 111 aa  62  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.816784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4166  ribosome-binding factor A  31.48 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000106795  hitchhiker  0.00000000804111 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1310  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.03706  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  38.1 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4876  ribosome-binding factor A  27.1 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.26776 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  43.04 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  39.51 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1314  ribosome-binding factor A  32.91 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3046  ribosome-binding factor A  34.18 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  34.18 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0368  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159363  normal  0.435945 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0399  ribosome-binding factor A  34.82 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000842232  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl371  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.61579e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0393  ribosome-binding factor A  23.42 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8062  predicted protein  31.71 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00519858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1461  ribosome-binding factor A  30.77 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00371256  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  38.27 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  38.27 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  36.71 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1069  ribosome-binding factor A  25.71 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03290  ribosome-binding factor A  28.04 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441975  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  33.73 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  31.96 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  35.44 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0370  ribosome-binding factor A  33.73 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000258707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  33.75 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  32.93 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  33.75 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  33.75 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01304  ribosome-binding factor A  28.72 
 
 		 115 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.435847  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2814  ribosome-binding factor A  26.05 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  39.24 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0403  ribosome-binding factor A  31.07 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000114311  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  31.33 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  27.1 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  30.28 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0490  ribosome-binding factor A  35.29 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  30.28 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  30.12 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  31.71 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  32.5 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  32.5 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  32.5 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  32.5 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  32.5 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  30.61 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002610  ribosome-binding factor A  32.86 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1778  ribosome-binding factor A  32.93 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00495715  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  32.5 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1131  ribosome-binding factor A  32.67 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0305445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  30.85 
 
 		 133 aa  43.5  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  32.5 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  32.5 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  30.53 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0265365 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  30.86 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1124  ribosome-binding factor A  29.66 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.559774  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0829  ribosome-binding factor A  34.18 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320879  hitchhiker  0.00000296727 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1255  ribosome-binding factor A  28.42 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3752  ribosome-binding factor A  31.68 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00104734  unclonable  0.0000134979 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2818  ribosome-binding factor A  28.74 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  30.49 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  32.1 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0230  ribosome-binding factor A  32.05 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00202036  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  26.97 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0781  ribosome-binding factor A  28.75 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  32.53 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  30.49 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  30.49 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  30.49 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  30.28 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  30.93 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0327  ribosome-binding factor A  26.26 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01761  ribosome-binding factor A  31.58 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.138056  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  30.49 
 
 		 138 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  27.1 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  28.95 
 
 		 128 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  28.95 
 
 		 128 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0601  ribosome-binding factor A  30.77 
 
 		 135 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  36.62 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  30.77 
 
 		 137 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  27.16 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03395  ribosome-binding factor A  31.43 
 
 		 137 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  34.94 
 
 		 132 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0769  ribosome-binding factor A  32.26 
 
 		 124 aa  42  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>