298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_3046 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_3046  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 141 aa  286  7e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3629  ribosome-binding factor A  54.55 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.445652  normal  0.0497582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4066  ribosome-binding factor A  48.39 
 
 		 134 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2071  ribosome-binding factor A  50.81 
 
 		 145 aa  120  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.573719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4386  ribosome-binding factor A  49.19 
 
 		 134 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.4784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3442  ribosome-binding factor A  47.58 
 
 		 134 aa  120  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.728771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0058  ribosome-binding factor A  45.97 
 
 		 138 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0226  ribosome-binding factor A  49.59 
 
 		 140 aa  120  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3931  ribosome-binding factor A  50 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1046  ribosome-binding factor A  42.55 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0038  ribosome-binding factor A  44.6 
 
 		 164 aa  117  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623045  normal  0.446494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2818  ribosome-binding factor A  43.38 
 
 		 145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2294  ribosome-binding factor A  41.98 
 
 		 155 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.121706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0230  ribosome-binding factor A  45.38 
 
 		 136 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00202036  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0170  ribosome-binding factor A  47.15 
 
 		 137 aa  114  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0610976  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2696  ribosome-binding factor A  43.31 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.674256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3726  ribosome-binding factor A  47.24 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2922  ribosome-binding factor A  43.31 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0301917  normal  0.0601013 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0032  ribosome-binding factor A  45.08 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0025  ribosome-binding factor A  44.09 
 
 		 146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_004310  BR2166  ribosome-binding factor A  47.33 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0746  ribosome-binding factor A  47.54 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0601  ribosome-binding factor A  44.19 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2078  ribosome-binding factor A  47.33 
 
 		 197 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0292  ribosome-binding factor A  48.33 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.887654  normal  0.0167928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2610  ribosome-binding factor A  44.6 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3782  ribosome-binding factor A  47.62 
 
 		 164 aa  110  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0911878  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0481  ribosome-binding factor A  45.6 
 
 		 137 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214856  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3815  ribosome-binding factor A  47.24 
 
 		 132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104911  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4619  ribosome-binding factor A  42.42 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0439  ribosome-binding factor A  43.51 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3041  ribosome-binding factor A  44.62 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.603703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0086  ribosome-binding factor A  42.31 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2924  ribosome-binding factor A  43.97 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332986  normal  0.135151 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2799  ribosome-binding factor A  41.98 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285538  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0613  ribosome-binding factor A  45.19 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.440259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1106  ribosome-binding factor A  42.14 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2768  ribosome-binding factor A  42.14 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4036  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1255  ribosome-binding factor A  45.45 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2488  ribosome-binding factor A  39.86 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266682  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  36.61 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  38.32 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  38.32 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  37.08 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  35.19 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  36.04 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  39.09 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  35.96 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  39.45 
 
 		 130 aa  67  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  34.55 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  37.39 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  31.67 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  31.67 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  31.36 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  35.94 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0319  ribosome-binding factor A  30.91 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  32.69 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3680  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00259102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  32.46 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01304  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.435847  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  34.29 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  30.28 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  34.29 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  34.29 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  30.28 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  32.43 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  34.58 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  32.43 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  33.02 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  33.02 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  34.58 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  32.73 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3629  ribosome-binding factor A  33.06 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  31.73 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_854  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000358033  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  30.77 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  32 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  34.09 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  30.77 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  31.07 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1920  ribosome-binding factor A  31.2 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0348034  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  32 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1124  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.559774  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2814  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>