231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2294 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2294  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 155 aa  313  5e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.121706 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1046  ribosome-binding factor A  67.86 
 
 		 141 aa  206  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2696  ribosome-binding factor A  63.03 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.674256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2922  ribosome-binding factor A  63.03 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0301917  normal  0.0601013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0058  ribosome-binding factor A  59.38 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2818  ribosome-binding factor A  63.03 
 
 		 145 aa  158  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0032  ribosome-binding factor A  60.68 
 
 		 137 aa  153  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4619  ribosome-binding factor A  61.86 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2610  ribosome-binding factor A  61.86 
 
 		 139 aa  150  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0601  ribosome-binding factor A  56.59 
 
 		 135 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0230  ribosome-binding factor A  56.15 
 
 		 136 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00202036  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0025  ribosome-binding factor A  56.35 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3726  ribosome-binding factor A  59.66 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0439  ribosome-binding factor A  56.06 
 
 		 137 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0481  ribosome-binding factor A  56.25 
 
 		 137 aa  146  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214856  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0292  ribosome-binding factor A  54.62 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.887654  normal  0.0167928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3442  ribosome-binding factor A  50.83 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.728771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4066  ribosome-binding factor A  46.67 
 
 		 134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2924  ribosome-binding factor A  45.8 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332986  normal  0.135151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3782  ribosome-binding factor A  46.67 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0911878  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2768  ribosome-binding factor A  47.15 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2166  ribosome-binding factor A  46.56 
 
 		 150 aa  116  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0170  ribosome-binding factor A  49.58 
 
 		 137 aa  116  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0610976  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3931  ribosome-binding factor A  50.43 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3046  ribosome-binding factor A  41.98 
 
 		 141 aa  115  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2078  ribosome-binding factor A  46.56 
 
 		 197 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1106  ribosome-binding factor A  45.53 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3041  ribosome-binding factor A  44.36 
 
 		 135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.603703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0086  ribosome-binding factor A  45.38 
 
 		 131 aa  113  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4386  ribosome-binding factor A  45 
 
 		 134 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.4784 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4036  ribosome-binding factor A  44.62 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0746  ribosome-binding factor A  44.78 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321784  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2799  ribosome-binding factor A  45.38 
 
 		 138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285538  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0613  ribosome-binding factor A  44.44 
 
 		 136 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.440259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3629  ribosome-binding factor A  44.62 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.445652  normal  0.0497582 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0226  ribosome-binding factor A  46.61 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2488  ribosome-binding factor A  42.98 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266682  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3815  ribosome-binding factor A  43.22 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104911  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0038  ribosome-binding factor A  37.68 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623045  normal  0.446494 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1255  ribosome-binding factor A  41.8 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2071  ribosome-binding factor A  41.6 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.573719 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  38.74 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  35.51 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 		 118 aa  67  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 		 118 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 		 118 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  34.58 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  37.4 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  36.59 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  36.51 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  37.72 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  31.19 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  34.26 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  34.26 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  32.41 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  35.85 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  31.21 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0319  ribosome-binding factor A  28.85 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  32.81 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  34.48 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  34.48 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  30.63 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0923  ribosome-binding factor A  28.83 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.816784 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  32.41 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  31.43 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8062  predicted protein  38.27 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00519858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0982  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.385895  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  31.48 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  31.78 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2118  Ribosome-binding factor A-like protein  33.05 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.376562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  30.08 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  28.97 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  34.34 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  30.08 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  34.34 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  34.23 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0998  ribosome-binding factor A  34.82 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00108919  normal  0.25507 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_854  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000358033  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0873  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  30.91 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  31.25 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  30.77 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  29.46 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>