174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2166 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2166  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 150 aa  304  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2078  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 197 aa  303  4.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0746  ribosome-binding factor A  88.67 
 
 		 150 aa  266  5.9999999999999995e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321784  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4386  ribosome-binding factor A  71.09 
 
 		 134 aa  187  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.4784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3442  ribosome-binding factor A  70.54 
 
 		 134 aa  187  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.728771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4066  ribosome-binding factor A  70.31 
 
 		 134 aa  186  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0170  ribosome-binding factor A  71.77 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0610976  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1255  ribosome-binding factor A  67.44 
 
 		 148 aa  174  4e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3931  ribosome-binding factor A  69.17 
 
 		 133 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0292  ribosome-binding factor A  58.06 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.887654  normal  0.0167928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0481  ribosome-binding factor A  49.64 
 
 		 137 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214856  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2818  ribosome-binding factor A  53.03 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0439  ribosome-binding factor A  46.38 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0230  ribosome-binding factor A  47.83 
 
 		 136 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00202036  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1046  ribosome-binding factor A  49.62 
 
 		 141 aa  125  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0032  ribosome-binding factor A  47.45 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2610  ribosome-binding factor A  49.62 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4619  ribosome-binding factor A  51.97 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0058  ribosome-binding factor A  48.92 
 
 		 138 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2696  ribosome-binding factor A  48.2 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.674256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2922  ribosome-binding factor A  48.57 
 
 		 145 aa  124  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0301917  normal  0.0601013 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3726  ribosome-binding factor A  53.08 
 
 		 142 aa  124  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0601  ribosome-binding factor A  45.59 
 
 		 135 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0025  ribosome-binding factor A  46.72 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0613  ribosome-binding factor A  48.85 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.440259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3629  ribosome-binding factor A  50.72 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.445652  normal  0.0497582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3815  ribosome-binding factor A  51.2 
 
 		 132 aa  121  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104911  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2294  ribosome-binding factor A  45.58 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.121706 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3046  ribosome-binding factor A  47.33 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0226  ribosome-binding factor A  45.74 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2071  ribosome-binding factor A  47.15 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.573719 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2924  ribosome-binding factor A  44.53 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332986  normal  0.135151 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1106  ribosome-binding factor A  43.75 
 
 		 140 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2488  ribosome-binding factor A  47.62 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266682  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3782  ribosome-binding factor A  46.61 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0911878  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2768  ribosome-binding factor A  42.97 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2799  ribosome-binding factor A  44.29 
 
 		 138 aa  100  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285538  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3041  ribosome-binding factor A  43.07 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.603703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0038  ribosome-binding factor A  35.15 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623045  normal  0.446494 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0086  ribosome-binding factor A  43.33 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4036  ribosome-binding factor A  37.58 
 
 		 143 aa  94  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  34.78 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  31.25 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  32.82 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  31.25 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0466  ribosome-binding factor A  32.73 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  31.25 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  33.58 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  30.36 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  32.26 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  29.13 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  32.06 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  32.06 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0564  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2815  ribosome-binding factor A  31.53 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473664  hitchhiker  0.00211169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  32.06 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  32.43 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  28.79 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  27.05 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  29.93 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  28.44 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1069  ribosome-binding factor A  28.69 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  30.3 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  30.3 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  30.3 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  32.08 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  32.08 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0998  ribosome-binding factor A  26.19 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00108919  normal  0.25507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  31.06 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1143  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  28.12 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4876  ribosome-binding factor A  25.45 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.26776 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  32.43 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1131  ribosome-binding factor A  32.14 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0305445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  27.68 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3752  ribosome-binding factor A  32.14 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00104734  unclonable  0.0000134979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3680  ribosome-binding factor A  30.91 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00259102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2027  ribosome-binding factor A  28.8 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.373244  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3347  ribosome-binding factor A  28.87 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1413  ribosome-binding factor A  30.61 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  28.89 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  27.93 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  27.52 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0781  ribosome-binding factor A  28.95 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  29.46 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  29.37 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  31.78 
 
 		 131 aa  50.1  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  30.47 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  31.2 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  27.68 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1748  ribosome-binding factor A  37.84 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0187668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>