More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0226 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0226  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 140 aa  278  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2071  ribosome-binding factor A  63.11 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.573719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3782  ribosome-binding factor A  52.34 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0911878  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3046  ribosome-binding factor A  49.59 
 
 		 141 aa  120  8e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0058  ribosome-binding factor A  51.18 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1046  ribosome-binding factor A  49.19 
 
 		 141 aa  110  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0746  ribosome-binding factor A  46.51 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321784  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2696  ribosome-binding factor A  49.58 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.674256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2922  ribosome-binding factor A  49.58 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0301917  normal  0.0601013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0481  ribosome-binding factor A  47.69 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214856  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0032  ribosome-binding factor A  47.01 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2166  ribosome-binding factor A  46.34 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3629  ribosome-binding factor A  40.29 
 
 		 140 aa  107  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.445652  normal  0.0497582 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2078  ribosome-binding factor A  46.34 
 
 		 197 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4619  ribosome-binding factor A  48.76 
 
 		 135 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2818  ribosome-binding factor A  48.74 
 
 		 145 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2610  ribosome-binding factor A  50.42 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2294  ribosome-binding factor A  46.61 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.121706 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0025  ribosome-binding factor A  48.8 
 
 		 146 aa  104  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4066  ribosome-binding factor A  41.67 
 
 		 134 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0613  ribosome-binding factor A  46.03 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.440259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0292  ribosome-binding factor A  48.72 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.887654  normal  0.0167928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0170  ribosome-binding factor A  45.24 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0610976  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3442  ribosome-binding factor A  40.46 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.728771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3726  ribosome-binding factor A  47.93 
 
 		 142 aa  100  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4386  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.4784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3931  ribosome-binding factor A  45.83 
 
 		 133 aa  98.6  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4036  ribosome-binding factor A  41.43 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0439  ribosome-binding factor A  44.78 
 
 		 137 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1255  ribosome-binding factor A  47.93 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0038  ribosome-binding factor A  36 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623045  normal  0.446494 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0601  ribosome-binding factor A  43.28 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2488  ribosome-binding factor A  44.17 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266682  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1106  ribosome-binding factor A  43.8 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3815  ribosome-binding factor A  42.5 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104911  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0230  ribosome-binding factor A  44.19 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00202036  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0086  ribosome-binding factor A  46.22 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2768  ribosome-binding factor A  43.7 
 
 		 137 aa  91.3  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3041  ribosome-binding factor A  42.52 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.603703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2924  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332986  normal  0.135151 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2799  ribosome-binding factor A  41.04 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285538  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  46.3 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  37.4 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  38.32 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  34.78 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  29.36 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  28.83 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  37.6 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  34.26 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1143  ribosome-binding factor A  41.28 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3474  ribosome-binding factor A  35.48 
 
 		 133 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  34.68 
 
 		 133 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3642  ribosome-binding factor A  35.48 
 
 		 133 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  34.68 
 
 		 133 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  32.17 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  39.81 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  35.51 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  33.87 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  31.19 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  34.68 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  34.68 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  34.68 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  34.68 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  38.89 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  34.68 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  34.68 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  34.68 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  30.28 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  38.89 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  34.68 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  34.68 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  34.86 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  33.88 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  32.17 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  32.17 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0204  ribosome-binding factor A  36.13 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  32.43 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  32.17 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  31.73 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  35.45 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  34.43 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  34.43 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>