293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1427 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1427  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 175 aa  341  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000533542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1417  ribosome-binding factor A  91.43 
 
 		 169 aa  232  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0421454  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07020  ribosome-binding factor A  62.41 
 
 		 148 aa  174  5e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1511  ribosome-binding factor A  61.03 
 
 		 144 aa  162  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.898255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10330  ribosome-binding factor A  57.43 
 
 		 169 aa  156  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.150571  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23440  ribosome-binding factor A  55.63 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.487539  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2118  Ribosome-binding factor A-like protein  58.96 
 
 		 160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.376562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2315  ribosome-binding factor A  54.79 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0767134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1445  ribosome-binding factor A  61.03 
 
 		 171 aa  149  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.084347  normal  0.20066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1184  ribosome-binding factor A  55.26 
 
 		 189 aa  147  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.352255 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3560  ribosome-binding factor A  54.42 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466003  normal  0.834335 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4038  ribosome-binding factor A  54.29 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.432163 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1513  ribosome-binding factor A  63.97 
 
 		 150 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.121246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3964  ribosome-binding factor A  54.41 
 
 		 171 aa  144  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1020  ribosome-binding factor A  50.74 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  53.59 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1717  ribosome-binding factor A  57.52 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.264807  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1212  ribosome-binding factor A  50.34 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.316878  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3590  ribosome-binding factor A  56.38 
 
 		 147 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0900161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3189  ribosome-binding factor A  49.39 
 
 		 162 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0454193  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0780  ribosome-binding factor A  57.14 
 
 		 151 aa  132  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2066  ribosome-binding factor A  54.79 
 
 		 171 aa  131  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0366548  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2083  ribosome-binding factor A  54.79 
 
 		 171 aa  131  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2129  ribosome-binding factor A  54.79 
 
 		 171 aa  131  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.0220711 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11490  ribosome-binding factor A  50 
 
 		 143 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871158  normal  0.911894 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1329  ribosome-binding factor A  44.81 
 
 		 156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5832  ribosome-binding factor A  59.57 
 
 		 149 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.154912  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1063  ribosome-binding factor A  57.72 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0689148  normal  0.0406746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14590  ribosome-binding factor A  58.06 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2153  ribosome-binding factor A  51.63 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10459  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  58.09 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1372  ribosome-binding factor A  47.06 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.589597  normal  0.116766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7740  ribosome-binding factor A  58.33 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2209  ribosome-binding factor A  52.23 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000323925  decreased coverage  0.000414746 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1744  ribosome-binding factor A  48.55 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1451  ribosome-binding factor A  46.31 
 
 		 145 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0286  ribosome-binding factor A  45.19 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  45.28 
 
 		 126 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12853  ribosome-binding factor A  46.71 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.73354e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  42.45 
 
 		 127 aa  94.7  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1124  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 121 aa  91.3  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.559774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  42.2 
 
 		 118 aa  89.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  42.2 
 
 		 118 aa  89  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  42.2 
 
 		 118 aa  89  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  42.2 
 
 		 118 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1354  ribosome-binding factor A  40.18 
 
 		 117 aa  88.6  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  42.2 
 
 		 118 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  41.28 
 
 		 118 aa  88.2  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  41.28 
 
 		 118 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  42.2 
 
 		 118 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  37.74 
 
 		 118 aa  87.4  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  41.28 
 
 		 118 aa  87  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  41.28 
 
 		 118 aa  87  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  41.28 
 
 		 118 aa  87  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  40.98 
 
 		 138 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  40.16 
 
 		 138 aa  84.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  41.23 
 
 		 139 aa  84.3  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0700  ribosome-binding factor A  38.39 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00262073  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0384  ribosome-binding factor A  35.04 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  39.58 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  35.85 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  33.96 
 
 		 119 aa  77  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 130 aa  77  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  37.74 
 
 		 122 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  35.45 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  33.96 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  33.96 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0382  ribosome-binding factor A  36.61 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  36.84 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  35.51 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  38.53 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1143  ribosome-binding factor A  33.61 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  38.78 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  34.58 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 118 aa  73.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  36.96 
 
 		 127 aa  73.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  35.29 
 
 		 123 aa  73.9  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 117 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 123 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  37.37 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0818  ribosome-binding factor A  34.23 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  34.82 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  38.38 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  37.74 
 
 		 121 aa  72  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  38.66 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 123 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  31.93 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  37.37 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  39.78 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>