264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0370 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0370  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 133 aa  275  2e-73  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  28.33 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  26.89 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  30.7 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  31.01 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  28.33 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  30.51 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  31.31 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  28.7 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  28.7 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  33.91 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  33.91 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0982  ribosome-binding factor A  30.09 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.385895  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  28.7 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  31.93 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  31.93 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  29.2 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  25.58 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  28.7 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1143  ribosome-binding factor A  31.36 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  28.7 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  31.67 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  28.7 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  22.73 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  28.91 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  27.83 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  30.3 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  27.83 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  28.45 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  27.68 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  27.83 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  28.45 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  29.82 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  27.93 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  27.83 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  27.83 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  25 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  31.19 
 
 		 122 aa  67  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  23.08 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  28.28 
 
 		 132 aa  66.6  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  26.96 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_854  ribosome-binding factor A  28.07 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000358033  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  26.15 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  26.15 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  24.03 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  30.63 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0873  ribosome-binding factor A  32.61 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231797  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  29.36 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  26.89 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  26.89 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  29.57 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0319  ribosome-binding factor A  29.03 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  29.25 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  28 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  22.45 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  23.44 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1511  ribosome-binding factor A  26.45 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.898255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  26.72 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  29.35 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  32.22 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  29.36 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3851  ribosome-binding factor A  31.37 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.258524  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2799  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285538  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  24.32 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1329  ribosome-binding factor A  26.45 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4036  ribosome-binding factor A  32.46 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23440  ribosome-binding factor A  24.81 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.487539  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  24.19 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1069  ribosome-binding factor A  30.91 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  26.32 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0601  ribosome-binding factor A  34.21 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  26.72 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  29.47 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0158  ribosome-binding factor A  29.06 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  26.32 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  21.05 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  26.32 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  23.08 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  25.76 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  26.32 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0230  ribosome-binding factor A  31.36 
 
 		 136 aa  57  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00202036  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0781  ribosome-binding factor A  30.63 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  30.11 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  27.83 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1212  ribosome-binding factor A  24.17 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.316878  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0923  ribosome-binding factor A  30.63 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.816784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3752  ribosome-binding factor A  26.96 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00104734  unclonable  0.0000134979 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3560  ribosome-binding factor A  24.06 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466003  normal  0.834335 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  25.66 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  32.43 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  26.55 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3347  ribosome-binding factor A  24.82 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  25.38 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  25.38 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  25.38 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  25.38 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>