More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0504 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  100 
 
 		 282 aa  584  1e-166  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  60.64 
 
 		 290 aa  355  2.9999999999999997e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  57.25 
 
 		 288 aa  337  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  55.8 
 
 		 299 aa  337  9.999999999999999e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  54.71 
 
 		 290 aa  329  2e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  55.6 
 
 		 292 aa  330  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  51.96 
 
 		 304 aa  314  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  52.35 
 
 		 328 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  52.92 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  51.06 
 
 		 298 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 298 aa  298  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  53.24 
 
 		 328 aa  294  9e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  46.98 
 
 		 292 aa  291  8e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 298 aa  291  8e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  48.94 
 
 		 298 aa  291  9e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  50.73 
 
 		 287 aa  291  1e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  48.58 
 
 		 298 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  48.58 
 
 		 298 aa  289  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  48.58 
 
 		 298 aa  289  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  48.58 
 
 		 298 aa  289  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  48.58 
 
 		 298 aa  289  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  48.58 
 
 		 298 aa  289  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  48.58 
 
 		 298 aa  289  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  48.58 
 
 		 298 aa  289  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  48.19 
 
 		 290 aa  288  6e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 304 aa  288  8e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 305 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  50.55 
 
 		 312 aa  287  1e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  48.23 
 
 		 298 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  48.75 
 
 		 282 aa  287  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  50.55 
 
 		 321 aa  287  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 305 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  48.01 
 
 		 302 aa  286  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  49.64 
 
 		 321 aa  286  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1149  lipoyl synthase  48.54 
 
 		 292 aa  285  7e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025967  normal  0.19755 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  49.27 
 
 		 298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  48.75 
 
 		 334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  47.16 
 
 		 303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  47.16 
 
 		 303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  47.81 
 
 		 299 aa  281  6.000000000000001e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  47.31 
 
 		 318 aa  281  9e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 294 aa  280  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0245  lipoyl synthase  48.42 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  45.91 
 
 		 300 aa  281  1e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  46.76 
 
 		 291 aa  280  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  48.92 
 
 		 348 aa  280  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  45.45 
 
 		 287 aa  279  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  47.12 
 
 		 338 aa  278  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  47.12 
 
 		 338 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 368 aa  278  5e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  47.12 
 
 		 338 aa  278  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 326 aa  278  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  47.12 
 
 		 338 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 326 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  46.74 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  48.01 
 
 		 351 aa  277  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  46.52 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  47.48 
 
 		 335 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  46.4 
 
 		 323 aa  275  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  47.12 
 
 		 340 aa  276  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  46.04 
 
 		 327 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  46.76 
 
 		 324 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  48.38 
 
 		 309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  46.76 
 
 		 314 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  48.21 
 
 		 331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  46.91 
 
 		 321 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  46.59 
 
 		 320 aa  272  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  46.74 
 
 		 296 aa  271  6e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1370  lipoyl synthase  47.48 
 
 		 288 aa  272  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.472643 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  46.18 
 
 		 317 aa  271  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0749  lipoyl synthase  46.04 
 
 		 347 aa  271  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.58387  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  45.09 
 
 		 310 aa  270  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  46.04 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  44.96 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  47.81 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  46.29 
 
 		 339 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  45.85 
 
 		 315 aa  269  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  46.55 
 
 		 323 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  47.65 
 
 		 350 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  46.29 
 
 		 318 aa  269  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  46.74 
 
 		 318 aa  269  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  45.85 
 
 		 315 aa  269  4e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0184  lipoyl synthase  46.29 
 
 		 333 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  0.998847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  46.18 
 
 		 322 aa  269  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  47.08 
 
 		 317 aa  269  5e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0744  lipoyl synthase  45.68 
 
 		 347 aa  268  5e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  46.79 
 
 		 337 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  46.04 
 
 		 321 aa  268  5.9999999999999995e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0178  lipoyl synthase  46.29 
 
 		 333 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  46.79 
 
 		 326 aa  268  7e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  46.79 
 
 		 326 aa  268  7e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  47.12 
 
 		 321 aa  268  8e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  45.88 
 
 		 355 aa  268  8.999999999999999e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  46.18 
 
 		 323 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  46.91 
 
 		 316 aa  267  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0086  lipoyl synthase  45.23 
 
 		 331 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0470  lipoyl synthase  44.88 
 
 		 332 aa  267  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  44.96 
 
 		 319 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>