90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4705 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 550 aa  1119    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  40.4 
 
 		 639 aa  368  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  40.7 
 
 		 641 aa  359  8e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  40.07 
 
 		 551 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  40.68 
 
 		 574 aa  341  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  39.26 
 
 		 531 aa  341  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  40.15 
 
 		 533 aa  340  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  38.73 
 
 		 581 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  39.74 
 
 		 604 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  38.31 
 
 		 529 aa  315  9.999999999999999e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  37.81 
 
 		 563 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  37.18 
 
 		 561 aa  311  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  39.32 
 
 		 491 aa  300  4e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  37.08 
 
 		 600 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  35.53 
 
 		 666 aa  289  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  35.53 
 
 		 666 aa  289  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  37.96 
 
 		 550 aa  284  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  38.05 
 
 		 593 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  38.15 
 
 		 591 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  36.3 
 
 		 622 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  37.71 
 
 		 572 aa  270  7e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  35.52 
 
 		 530 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  35.24 
 
 		 624 aa  263  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  35.23 
 
 		 586 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  35.23 
 
 		 586 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  35.67 
 
 		 542 aa  261  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  33.75 
 
 		 581 aa  253  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  33.75 
 
 		 581 aa  253  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  34.86 
 
 		 539 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  32.25 
 
 		 571 aa  239  5.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  39.02 
 
 		 645 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  38.06 
 
 		 632 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  33.11 
 
 		 658 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  33.78 
 
 		 606 aa  226  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  32.77 
 
 		 508 aa  221  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  33.52 
 
 		 589 aa  221  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  31.91 
 
 		 543 aa  205  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  32.38 
 
 		 518 aa  203  5e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  32.53 
 
 		 548 aa  203  6e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  31.28 
 
 		 643 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  31.83 
 
 		 629 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  29.65 
 
 		 513 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  29.84 
 
 		 568 aa  169  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  50.85 
 
 		 531 aa  168  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  30.25 
 
 		 543 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  30.69 
 
 		 555 aa  161  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  29.82 
 
 		 531 aa  160  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  30.97 
 
 		 514 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  29.59 
 
 		 527 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  29.53 
 
 		 518 aa  147  7.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  41.33 
 
 		 578 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  45.66 
 
 		 510 aa  139  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  42.78 
 
 		 475 aa  138  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  42.78 
 
 		 561 aa  138  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  42.86 
 
 		 528 aa  136  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  43.37 
 
 		 500 aa  136  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  43.75 
 
 		 524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  51.91 
 
 		 188 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  41.53 
 
 		 544 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  65.67 
 
 		 261 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  39.6 
 
 		 262 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  39.6 
 
 		 262 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  32.26 
 
 		 450 aa  90.1  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  26.05 
 
 		 515 aa  86.7  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  36.36 
 
 		 515 aa  74.3  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  39.39 
 
 		 485 aa  69.7  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  24 
 
 		 414 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  38.68 
 
 		 946 aa  66.6  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  23.64 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  22.35 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  23.04 
 
 		 415 aa  57  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  30.56 
 
 		 932 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  36.44 
 
 		 416 aa  55.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  28 
 
 		 343 aa  52.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  32.99 
 
 		 255 aa  51.6  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  30.48 
 
 		 919 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  30.51 
 
 		 673 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  29.14 
 
 		 186 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  34.02 
 
 		 575 aa  48.5  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  30.43 
 
 		 330 aa  48.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  36.36 
 
 		 361 aa  47.4  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  29.84 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  32.29 
 
 		 558 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  40 
 
 		 441 aa  46.2  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  25.82 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  36.51 
 
 		 1821 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  35.85 
 
 		 375 aa  44.3  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  42.86 
 
 		 1036 aa  43.9  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  37.04 
 
 		 784 aa  43.9  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  30.88 
 
 		 536 aa  43.5  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>