64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3662 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  100 
 
 
124 aa  253  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  58.06 
 
 
124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  58.06 
 
 
124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2140  cytochrome c class I  58.06 
 
 
124 aa  152  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.986487  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4020  cytochrome c, class I  57.14 
 
 
124 aa  148  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442148  normal  0.970341 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3942  cytochrome c class I  50.46 
 
 
109 aa  120  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.914915 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  50 
 
 
145 aa  120  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2140  cytochrome c, class I  57.47 
 
 
87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0189398  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  49.52 
 
 
125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  43.8 
 
 
130 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0695  cytochrome c  45.71 
 
 
129 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  42.48 
 
 
137 aa  97.8  5e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15291  cytochrome cM  38.33 
 
 
129 aa  97.1  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.427205  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0717  cytochrome cM  48.24 
 
 
129 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  44.19 
 
 
100 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  44.19 
 
 
100 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  43.02 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0656  cytochrome c, class I  37.65 
 
 
283 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  38.03 
 
 
330 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0018  cytochrome c, class I  36.76 
 
 
138 aa  47  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  40.85 
 
 
329 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  35.71 
 
 
1139 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2412  cytochrome c class I  32.2 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000673714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  44.64 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2102  cytochrome c, class I  37.66 
 
 
268 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.895116  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0848  cytochrome c class I  29.17 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3018  cytochrome c class I  35.94 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0223373  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  31.5 
 
 
284 aa  44.7  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1909  cytochrome c, class I  31.43 
 
 
206 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0159  cytochrome c class I  37.31 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0490  cytochrome c class I  34.72 
 
 
254 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.56 
 
 
308 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  40 
 
 
1040 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  31.08 
 
 
272 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  33.33 
 
 
381 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  28.42 
 
 
273 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  32.79 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  31.08 
 
 
272 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2538  cytochrome c, class I  54.29 
 
 
313 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  31.08 
 
 
272 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  31.94 
 
 
546 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0062  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
704 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  32.88 
 
 
373 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0473  cytochrome c class I  35.29 
 
 
202 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1827  cytochrome c, class I  29.69 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4143  cytochrome c class I  34.38 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000375642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4514  cytochrome c-550  34.38 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000708555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4313  cytochrome c-550  34.38 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.74805e-54 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4193  cytochrome c-550  34.38 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000176262  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  40.91 
 
 
355 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4041  cytochrome c-550  34.38 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000123285  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  53.85 
 
 
352 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  32 
 
 
278 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2042  cytochrome c, class I  35.29 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  31.3 
 
 
270 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.33 
 
 
1023 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6477  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  31.25 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633318  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1798  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.63 
 
 
292 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  29.79 
 
 
259 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2618  cytochrome c-555  34.25 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2655  cytochrome c class I  31.68 
 
 
144 aa  40  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2077  cytochrome c class I  28.95 
 
 
153 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  25.64 
 
 
556 aa  40.4  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3041  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  40 
 
 
286 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>