29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6477 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6477  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  100 
 
 		 144 aa  299  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633318  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2426  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (xoxG)  72.92 
 
 		 139 aa  219  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00658149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4973  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  65.05 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.437867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3394  hypothetical protein  58.1 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.928771  decreased coverage  0.00867638 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2525  hypothetical protein  57.84 
 
 		 199 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3107  hypothetical protein  49.18 
 
 		 127 aa  130  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3041  hypothetical protein  56.38 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2618  cytochrome c-555  38.71 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0058  hypothetical protein  32.18 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.771056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3517  hypothetical protein  34.91 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404669  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1780  putative cytochrome c protein  31.13 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218363  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1586  putative cytochrome c protein  31.73 
 
 		 175 aa  51.2  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5753  hypothetical protein  28.85 
 
 		 203 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0509  hypothetical protein  32.99 
 
 		 203 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0951715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3270  hypothetical protein  29.41 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100674 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5313  hypothetical protein  30 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.466467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5978  hypothetical protein  28.85 
 
 		 203 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 530 aa  43.5  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1810  hypothetical protein  31.46 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.553149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0656  cytochrome c, class I  34.94 
 
 		 283 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1762  hypothetical protein  31.46 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2146  hypothetical protein  31.46 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0021  hypothetical protein  25.42 
 
 		 226 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1944  hypothetical protein  23.78 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5969  putative cytochrome c protein  28.3 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2102  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 268 aa  40.8  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.895116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1237  cytochrome c553i  24.04 
 
 		 176 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.329607 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2579  cytochrome c553i  24.04 
 
 		 176 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>