31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1780 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1780  putative cytochrome c protein  100 
 
 		 182 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218363  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5969  putative cytochrome c protein  66.23 
 
 		 159 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1586  putative cytochrome c protein  58.08 
 
 		 175 aa  207  8e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5978  hypothetical protein  61.54 
 
 		 203 aa  200  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5753  hypothetical protein  52.13 
 
 		 203 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0509  hypothetical protein  57.42 
 
 		 203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0951715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3942  putative cytochrome c protein  57.14 
 
 		 175 aa  186  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1810  hypothetical protein  62.41 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.553149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2146  hypothetical protein  62.41 
 
 		 199 aa  181  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1944  hypothetical protein  52.5 
 
 		 176 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1762  hypothetical protein  60.28 
 
 		 199 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3270  hypothetical protein  53.79 
 
 		 171 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3517  hypothetical protein  52 
 
 		 189 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404669  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1237  cytochrome c553i  55 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.329607 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2579  cytochrome c553i  55 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0021  hypothetical protein  53.15 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0477  cytochrome c protein  56.93 
 
 		 181 aa  162  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5313  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  101  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.466467 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5693  hypothetical protein  50 
 
 		 165 aa  99  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2618  cytochrome c-555  41.11 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3041  hypothetical protein  36.8 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3107  hypothetical protein  34.58 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3394  hypothetical protein  36.7 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.928771  decreased coverage  0.00867638 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4973  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  31.9 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.437867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2525  hypothetical protein  35.92 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2426  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (xoxG)  31.13 
 
 		 139 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00658149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6477  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  30.84 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633318  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0172  hypothetical protein  27.56 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  32.29 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0058  hypothetical protein  33.73 
 
 		 137 aa  42.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.771056 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0101  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 		 193 aa  41.2  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>