31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1810 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1810  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  430  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.553149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2146  hypothetical protein  99.5 
 
 		 199 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1762  hypothetical protein  92.96 
 
 		 199 aa  333  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5753  hypothetical protein  67.65 
 
 		 203 aa  285  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5978  hypothetical protein  67.65 
 
 		 203 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0509  hypothetical protein  68.23 
 
 		 203 aa  270  8.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0951715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5969  putative cytochrome c protein  65.28 
 
 		 159 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1780  putative cytochrome c protein  62.41 
 
 		 182 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218363  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1586  putative cytochrome c protein  59.44 
 
 		 175 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3517  hypothetical protein  58.57 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404669  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3942  putative cytochrome c protein  55.94 
 
 		 175 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1944  hypothetical protein  54.55 
 
 		 176 aa  168  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2579  cytochrome c553i  54.55 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1237  cytochrome c553i  54.55 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.329607 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0021  hypothetical protein  50 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0477  cytochrome c protein  49.69 
 
 		 181 aa  160  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3270  hypothetical protein  53.28 
 
 		 171 aa  158  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100674 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5693  hypothetical protein  47.27 
 
 		 165 aa  97.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5313  hypothetical protein  40.31 
 
 		 137 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.466467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3041  hypothetical protein  37.17 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3107  hypothetical protein  37.84 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2618  cytochrome c-555  34.91 
 
 		 123 aa  62  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2525  hypothetical protein  39 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3394  hypothetical protein  34.51 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.928771  decreased coverage  0.00867638 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4973  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  32.17 
 
 		 148 aa  52.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.437867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2426  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (xoxG)  31.13 
 
 		 139 aa  51.6  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00658149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6477  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  30.77 
 
 		 144 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633318  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  30 
 
 		 249 aa  45.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0172  hypothetical protein  26.27 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3925  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 975 aa  43.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1855  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.91 
 
 		 996 aa  41.6  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>