33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3394 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3394  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  327  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.928771  decreased coverage  0.00867638 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3107  hypothetical protein  85.59 
 
 		 127 aa  211  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3041  hypothetical protein  71.97 
 
 		 134 aa  200  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2525  hypothetical protein  79.41 
 
 		 199 aa  176  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2426  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (xoxG)  53.03 
 
 		 139 aa  140  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00658149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4973  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  48.2 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.437867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6477  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  58.1 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633318  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2618  cytochrome c-555  41.67 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1586  putative cytochrome c protein  35.92 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0058  hypothetical protein  29.6 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.771056 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5313  hypothetical protein  31.85 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.466467 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5693  hypothetical protein  34.01 
 
 		 165 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0509  hypothetical protein  37.61 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0951715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3270  hypothetical protein  34.13 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5969  putative cytochrome c protein  37.14 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5753  hypothetical protein  37.27 
 
 		 203 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0021  hypothetical protein  32.14 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1780  putative cytochrome c protein  36.7 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218363  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1944  hypothetical protein  28.68 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3942  putative cytochrome c protein  34.82 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5978  hypothetical protein  36.36 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3517  hypothetical protein  36.11 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404669  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0477  cytochrome c protein  32.5 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2579  cytochrome c553i  28.57 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1237  cytochrome c553i  28.57 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.329607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1810  hypothetical protein  35.05 
 
 		 207 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.553149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1762  hypothetical protein  35.05 
 
 		 199 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2146  hypothetical protein  35.05 
 
 		 199 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0490  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 254 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  30.19 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  41.18 
 
 		 530 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  32.53 
 
 		 130 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  41.3 
 
 		 493 aa  41.2  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>