32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3517 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3517  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  388  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404669  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5753  hypothetical protein  52.24 
 
 		 203 aa  208  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5978  hypothetical protein  51.74 
 
 		 203 aa  206  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0509  hypothetical protein  62.59 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0951715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3270  hypothetical protein  61.7 
 
 		 171 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5969  putative cytochrome c protein  56.55 
 
 		 159 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1586  putative cytochrome c protein  50.28 
 
 		 175 aa  180  9.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1780  putative cytochrome c protein  51.95 
 
 		 182 aa  174  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218363  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1762  hypothetical protein  60.43 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1810  hypothetical protein  58.57 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.553149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2146  hypothetical protein  58.57 
 
 		 199 aa  165  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1944  hypothetical protein  45.9 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0021  hypothetical protein  52.48 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3942  putative cytochrome c protein  50.71 
 
 		 175 aa  148  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1237  cytochrome c553i  53.54 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.329607 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2579  cytochrome c553i  53.54 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0477  cytochrome c protein  47.71 
 
 		 181 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5693  hypothetical protein  34.88 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5313  hypothetical protein  44.34 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.466467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3041  hypothetical protein  38.6 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3107  hypothetical protein  37.61 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2618  cytochrome c-555  35.24 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2525  hypothetical protein  38.89 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3394  hypothetical protein  36.11 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.928771  decreased coverage  0.00867638 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2426  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (xoxG)  35.71 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00658149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4973  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  35.9 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.437867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6477  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  34.91 
 
 		 144 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633318  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  32.08 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0058  hypothetical protein  32.41 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.771056 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0172  hypothetical protein  27.83 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2704  Quinoprotein glucose dehydrogenase  32.43 
 
 		 731 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3802  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.58 
 
 		 455 aa  41.6  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.503165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>