21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0172 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0172  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  360  5.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2618  cytochrome c-555  26.79 
 
 		 123 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1944  hypothetical protein  27.12 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5969  putative cytochrome c protein  27.97 
 
 		 159 aa  48.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1780  putative cytochrome c protein  27.56 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218363  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5313  hypothetical protein  27.33 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.466467 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0021  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  45.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5693  hypothetical protein  25.49 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5978  hypothetical protein  25.64 
 
 		 203 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3517  hypothetical protein  27.83 
 
 		 189 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404669  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0775  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  31.18 
 
 		 374 aa  44.7  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0709529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1237  cytochrome c553i  26.27 
 
 		 176 aa  44.7  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.329607 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2579  cytochrome c553i  26.27 
 
 		 176 aa  44.7  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0781  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.18 
 
 		 382 aa  44.3  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5753  hypothetical protein  28.81 
 
 		 203 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1586  putative cytochrome c protein  25.86 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3942  putative cytochrome c protein  26.27 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0058  hypothetical protein  29.51 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.771056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0509  hypothetical protein  25.42 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0951715  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2001  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.94 
 
 		 325 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3270  hypothetical protein  24.17 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100674 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>